日前，農業部透露，微生物肥料已成為我國新型肥料中產量、應用面積廣的品種。
據悉，目前我國新型肥料總產能在1600-1700萬噸，微生物肥料占到了56.4%，幾乎在所有作物上都有應用。
由于我國長期使用化學肥料，導致農業生產出現一系列問題，加上中國耕地復種指數高和連作生產，土壤持續生產能力下降，肥料利用率下降，土壤質量、農產品質量問題日益嚴重，而解決這些問題，離不開微生物肥料。
微生物肥料的功能特點與國家農業可持續發展道路相吻合，是國家戰略的必然選擇。其在提高肥料利用率、減少化肥用量方面大有作為。微生物肥料品種豐富，應用范圍廣，現在國家政策支持力度不斷加強。目前，微生物肥料產品涉及微生物功能菌劑、生物有機肥、復合微生物肥三大類產品，使用的菌種數量超過150種。
在產業政策和產業定位上，2013年發布的《生物產業發展規劃》，將微生物肥料列為高新技術產業和戰略新興產業，國家發改委將微生物肥料列為現代農業優先發展的技術之一。國家將在‘十三五’和更長時期支持和發展微生物肥料產業！預計未來微生物肥料將會占到肥料總量的15%左右，應用推廣面積達到4億畝以上。
據統計，目前國內微生物肥料生產企業已超過1000家，年產量1000萬噸，產值200億元。截至2015年10月，在農業部登記的微生物產品達2675個，累計應用面積超過2億畝。我國生產的微生物肥料更是打進國際市場，30個產品年出口量近20萬噸。
根據微生物肥料生產的標準，微生物肥料有六大功效：一是提供或活化養分的功能；二是產生促進作物生長活性物質的能力；三是促進有機物料腐熟功能；四是改善農產品品種功能；五是增強作物抗逆性；六是改良和修復土壤功能。