微生物肥料中的微生物菌群與土壤中原有的有益微生物共同形成優勢菌群，可促進土壤生態系統中碳、氮、氧等元素的良性循環，從而修復土壤生態環境系統。施用方法要注意使用條件，嚴格按照說明書操作。
1、微生物肥料對土壤條件要求比較嚴格。一般菌肥中的生物菌在土壤18℃-25℃時生命活動***為活躍，15℃以下時生命活動開始降低，10℃以下時活動能力已很微弱，甚至處于休眠狀態。因此，微生物肥料使用要注意土壤溫度，調節好土壤濕度。
2、注意施肥時期。微生物肥施入土壤后，生物菌需要一個適應、生長、供養、繁殖的過程，一般在15天后可發揮作用。如果作追施，在作物的營養臨界期前施用。施用時間適宜在清晨和傍晚或無雨陰天，這樣可避免陽光中的紫外線將微生物殺死。避免在高溫、干旱條件下使用。
3、微生物肥料不能長期泡在水中。在水田施用應干濕灌溉，促進生物菌活動。以好氣性微生物為主的產品，則盡量不要用在水田。
4、微生物菌劑在施足有機肥基礎上效果佳。如果土壤中的有機質供應充足，生物菌就會大量繁殖，抑制有害菌。反之，生物菌就會因食物缺乏而死亡。因此，作物定植前一定要施足有機肥。
5、微生物肥料可單獨使用，也可與其它肥料混合使用。但微生物肥料應避免與未腐熟的農家肥混用，否則，會因農家肥發酵產生的高溫殺死微生物而影響肥效。此外，避免與過酸、過堿的肥料混用。
6、避免與農藥同時使用。化學農藥都會不同程度抑制微生物的生長和繁殖，甚至殺死微生物。不要將菌肥與殺菌劑、殺蟲劑、除草劑和含硫的化肥（如硫酸鉀等）以及草木灰混合用。不用拌過殺蟲劑、殺菌劑的工具裝微生物肥料。
7、微生物肥料不宜久放，拆包后要及時施用，注意產品保質期。
以上就是微生物肥料施用時的注意事項。更多作物種植栽培管理技術和肥料小知識小技巧請關注火爆農化招商網。