小麥生長中后期是產量形成的關鍵時期，也是各種病蟲危害的盛發期，尤其是小麥抽穗揚花期一旦出現連陰雨天氣，小麥銹病、紋枯病、赤霉病、白粉病、小麥蚜蟲、小麥紅蜘蛛等病蟲害都會迅速發展。另外，小麥灌漿期一旦出現高溫低濕有風天氣，也會嚴重影響小麥灌漿成熟，千粒重下降，導致小麥減產。所以，適時開展防治，對奪取小麥豐產豐收至關重要。
小麥中后期主要病蟲害
小麥赤霉病。小麥開花初期（4月下旬），應根據病情采取預防措施，并在小麥穗上均勻噴霧。藥劑防治應選擇滲透性、耐雨水沖刷性和持效性較好的農藥，每畝可選用20%氰烯菌酯·己唑醇懸浮劑140毫升/畝，或40%戊唑·咪鮮胺懸浮劑20毫升/畝，或43%戊唑醇懸浮劑20毫升/畝，或40%丙硫菌唑·戊唑醇懸浮劑60毫升/畝，兌水30公斤-45公斤細霧噴施。
小麥條銹病。防治小麥條銹病可用5%己唑醇懸浮劑30毫升-40毫升/畝、或43%戊唑醇懸浮劑15克-20克/畝、或12.5%烯唑醇可濕性粉劑20克-30克/畝、或20%的三唑酮乳油60毫升-80毫升/畝、或30醚菌酯懸浮劑50克-70克/畝、或25%丙環唑乳油25毫升/畝，兌水30公斤噴霧。
小麥白粉病。防治小麥白粉病時，畝用5%己唑醇懸浮劑30毫升-40毫升或43%戊唑醇懸浮劑15克-20克或12.5%烯唑醇可濕性粉劑20克-30克或20%的三唑酮乳油60毫升-80毫升或30%醚菌酯懸浮劑50克-70克25%丙環唑乳油25毫升，兌水30公斤噴霧，間隔7天-10天噴一次，連防2次-3次。
蚜蟲。可用7.5%氯氟·吡蟲啉懸浮劑30克-40克，或50%吡蚜酮乳油15毫升，或25%噻蟲嗪水分散粒劑6克等。
紅蜘蛛。可用1.8%阿維菌素、15%噠螨靈等。
小麥病蟲害防治時間
小麥孕穗開花期（4月下旬-5月上旬）。此時氣溫升高，濕度加大，是病蟲害的高發期，要以防治病蟲害為主。由于防治赤霉病的時間較短，應以“一噴三防”為基礎，在混合藥液中添加微量營養肥和生長調節劑，有效控制病蟲害，節約成本，確保高產。
小麥灌漿期（5月中下旬）。此時是形成產量的關鍵時期，結合病蟲害防治進行葉面噴肥，以預防干熱風、增加粒重為主。
小麥病蟲害用藥推薦
合理配方是“葉面肥+殺蟲劑+殺菌劑+植物生長調節劑”。葉面肥重點選擇磷酸二氫鉀、尿素等；殺蟲劑可選擇觸殺性、內吸性啶蟲脒、吡蟲啉、菊酯類農藥等殺蟲劑；殺菌劑可選擇三唑酮、戊唑醇、咪鮮胺、氰烯菌酯等相互搭配使用，不得使用高毒、殘效期長的農藥。