大棚芹菜主要有斑枯病、軟腐病、菌核病、心腐病等病癥，這些病癥嚴重影響芹菜生長，下面讓我們來看一下這些病癥的表現及要如何防治。
芹菜斑枯病：該病主要危害葉片，也可危害葉柄和莖。葉片初生淡褐色油浸狀小斑，邊緣明顯，后擴大為圓形，邊緣褐色，中央淡褐色到灰褐色，病斑上生許多小黑點，病斑外有黃色暈圈。低溫高濕有利于病害發生和流行，氣溫20℃左右，相對濕度90%，潮濕多雨的天氣發病重。
芹菜軟腐病：該病多發生在芹菜移栽緩苗期或緩苗后的生產初期。一般先從柔嫩多汁的葉柄基部開始發病。發病初，病斑淡褐色，水漬狀，紡錘形或不規則形，稍凹陷，迅速擴展后內部組織呈黑褐色腐爛，有惡臭，殘留表皮。
芹菜早疫病：苗期到成株期均可發生，主要危害葉片，葉柄和莖也可染病。染病初期產生黃綠色水漬狀斑點，后發展為圓形、橢圓形、或不規則形灰褐色斑，稍凹陷。高溫、高濕、多露發病重。
預防措施可以從三方面著手：，選用抗病、耐病品種：如“津南實芹1號”、“美國西芹”、“夏芹”等。第二，種子處理：無病株采種，播種前用48℃溫水浸種30分鐘，可有效殺死種子上的病原菌。浸種時不斷攪動使之均勻受熱，然后將種子投入冷水中冷卻，晾干播種。第三，藥劑防治：發現病株立即拔除并用藥劑控制，防止蔓延。對斑枯病用3%農抗120水劑100倍液，75%百菌清可濕性粉劑600倍液，或70%甲基硫菌靈可濕性粉劑800倍液等防治；對軟腐病，在發病初期噴灑72%農用鏈霉素或新植霉素3000-4000倍液，或用14%絡氨銅水劑300倍液，或30%DT膠懸劑500倍液噴霧防治；對早疫病用77%可殺得500倍液，3%農抗120水劑100倍液，或50%多菌靈可濕性粉劑500倍液等防治；對菌核病用50%速克靈可濕性粉劑1500倍液，50%農利靈1000倍液，或50%菌核凈1000倍液噴霧防治。一般每7-10天施藥一次，連續用藥2次到3次。