油菜黑腐病在油菜各生育期均可受害，但以后期為主，病菌侵染根、莖、葉、角果。葉上病斑黃色，自葉緣向內發展，呈倒三角形，病區葉脈變為灰褐色，逐漸成黑色網狀，病斑擴展常致葉片干枯。
主莖、枝和花序受害，初生暗綠色油浸狀長條斑，后變為黑褐色病斑，病部產生大量乳黃色菌膿，多時呈黃色透明黏液狀，病部無臭味。患病的主莖、根維管束變黑，橫切面有黑環，主莖停止生長，萎縮卷曲，直至死亡。莢果上亦形成褐色或黑褐色斑塊，常略凹陷。患病新鮮種子上也有油浸狀褐色斑。
油菜黑腐病防治方法可從三方面進行。選育和種植抗病品種。加強栽培管理。適時播種，不宜過早，合理澆水，適期蹲苗，注意減少傷口，收獲后及時清潔田園。與非十字花科蔬菜進行2-3年輪作。從無病田或無病株上采種，不用噴灌，溝灌時不向植株潑水，施用腐熟肥料，適期遲播，高畦栽培，及時防治害蟲，防止重復侵染；種子消毒。
可用45%代森銨水劑300倍液浸種15-20分鐘，沖洗后晾干播種；或用50%琥膠肥酸銅可濕性粉劑按種子重量的0.4%拌種，可預防苗期黑腐病的發生；或用3％中生菌素水劑100倍液15ml浸拌200g種子，吸附后陰干；或用0.1%升汞水浸種20分鐘，或0.5%醋酸鉬溶液處理種子20分鐘，水洗后播種。
或用72%農用鏈霉素可溶性粉劑1000倍液浸種2小時，晾干后播種，均能有效地防治種子上攜帶的黑腐病菌；藥劑防治發病初期噴灑下列藥劑：72%農用硫酸鏈霉素可溶性粉劑3500倍液；90%新植霉素可溶性粉劑3000-4000倍液；50%氯溴異氰尿酸可濕性粉劑500-800倍液；14%絡氨銅水劑350倍液；12%松脂酸銅乳油600倍液，每隔7-10天噴1次，連防2-3次。但需要注意的是，油菜對銅劑敏感，用藥的時候一定要注意。