油菜黑腐病會在油菜幼苗和成株期均會發病。油菜葉脈間出現黑褐色，油菜的葉柄出現暗綠色水漬狀，有時還會出現黃色菌膿，油菜黑腐病的病斑擴展致油菜葉片直至油菜干枯。
油菜在抽薹后主軸上產生暗綠色水浸狀長條斑，在油菜濕度大時，溢出大量黃色菌膿，隨后油菜黑腐病漸漸變黑褐色導致油菜腐爛，油菜的角果感染油菜黑腐病出現干秕或枯死。
油菜黑腐病的病菌在種子上或遺留在土壤中的病殘體內及采種株上進行越冬。油菜幼苗出土時依附在子葉上的病菌從子葉邊緣的水孔或傷口侵入，引起油菜引發油菜黑腐病病害的發生。油菜黑腐病的細菌由果柄處維管束侵入，進入種子皮層或經莢皮的維管束進入種臍，致種內帶菌，會隨著病菌進行遠距離的傳播。
為了及時的防治油菜黑腐病，應采取有效的方式進行防治油菜黑腐病。農業人員應及時選用優質、抗病種的油菜品種進行播種；同時，選用好油菜品種后，及時對種子進行消毒，100ml水中加入0.6ml醋酸、2.9ml硫酸鋅溶解后溫度控制在39℃，浸種20分鐘，沖洗3分鐘后晾干播種，也可用45%代森銨水劑300倍液浸種15-20分鐘，沖洗后晾干播種；或用50%琥膠肥酸銅可濕性粉劑按種子重量的0.4%拌種可預防苗期黑腐病的發生。
同時，還可選用農抗751殺菌劑100倍液15ml浸拌2009種子，吸附后陰干；可以有效的防治油菜黑腐病。
農業人員應加強油菜間的管理，在油菜黑腐病發病初期，及時選用藥劑開始噴灑72%農用硫酸鏈霉素可溶性粉劑3500倍液或新植霉素100-200mg/kg、氯霉素50-100mg/kg、14%絡氨銅水劑350倍液、12%綠乳銅乳油600倍液，可以及時的控制油菜黑腐病，效果極為顯著。