功能性肥料是指除了肥料具有植物營養和培肥土壤的功能以外的特殊功能的肥料。它應該是適合于特定的土壤和作物，且不以特殊功能為主要目的。功能性肥料現在沒有一個特別準確的分類。因為是功能性肥料，所以都是按照功能進行分類。有改土型、保水型、促生型、除草型、殺蟲型、型等。除了有營養植物的功能以外，另外所具備的其它功能，我們都應該稱為功能性肥料。
只有符合四個要件，我們才能把它稱作為功能性肥料。，本身是能直接提供植物營養所必須的營養元素或者是培肥土壤；第二，必須具有一個特定的對象；第三，不能含有法律、法規不允許添加的物質成份；第四，不能以加強或是改善肥效為主要功能。
功能性肥料不僅是一種新型肥料，而且市場潛力很大。在功能性肥料的定位方面要嚴格強調三點要求：，它必須是肥料的附加功能，不能是主要功能；第二，不要是肥料的添加物；第三，不能大幅度增加肥料的成本。
現在功能性肥料的發展在我國還是剛剛起步，盡管在農業生產中早已使用，但作為一個肥料的新品種來講，應用、推廣的力度還比較小。目前存在的問題主要有以下幾個方面：，缺乏科學可靠的數據支持。在這個方面，希望我們有關功能性肥料的研發和生產部門，要有一個完整的、科學的數據來支持。而且它的對照是不含這種功能的等養分肥料才行，這樣的話，才能有可信的效益；第二，機理不大明確。往往是肆意夸大了效果，這對我們功能性肥料的發展是相當不利的；第三，缺乏規范。功能性肥料由于功能千差萬別，怎么來衡量這個功能需要出臺一個具體的法規和標準。
功能性肥料的發展將面臨三個趨勢：一是綠色化或是生態化的趨勢；二是專一化的趨勢；三是簡便化的趨勢。
功能性肥料是肥料家族中出現的一個新成員，我們可以明確把它稱為新型肥料，功能性肥料也是我們肥料發展的重要方向之一，這是不容置疑的。盡管我們現在的法律、法規上不允許在肥料里面添加植物生長調節劑，或農藥等，但現在也有很多使用者、專家都在探討，是不是可以讓它有條件地添加。所以說功能性肥料的發展在方向上還需要克服更多的研發及使用問題。功能性肥料的發展環境還需要我們行業的努力和自律，這樣才能使功能性肥料逐漸興旺發展起來。