天氣回暖是真菌細菌易于繁殖的時間，很多雜菌的發生還來源于發菌的過程，怎樣在發菌中降低或抑制雜菌的出現，就能能夠有效的降低病蟲害發生。在發發菌過程中，首先影響到的是種植環境的污染，進而間斷性的影響到了農業生產上的病害的發生，因此杜絕發菌中的雜菌的合成及排放是保護莊稼生長環境的首要問題。
在近些年的發展中，大多采用以防為主的方針策略，一般會采取一下可行的措施：
，調配基料營養的全面均衡，為食用菌菌絲提供豐富的營養基礎，確保其營養平衡、健壯有力；建議使用三維精素調配基料。
第二，做到棚前環境的清理，沒必要的堆積物，并噴施多菌靈等雙管齊下，選擇殺滅或者抑制病菌發生的農藥；
第三，提前處理菇棚（發菌場所），根據環境以及菇棚上批栽培的發病等情況，一般可使用200倍賽百09各噴施一遍，并予曬棚處理。
第四，對于雜菌多發地方應該增加防范，尤其是在保溫控濕的環境中。
第五，在發菌期間，應當根據具體的情況3-7天進行一次殺菌處理，要多選購幾種殺菌產品，以免產生抗藥性，交替使用，效果會更好，并間隔噴施氯氰菊酯類，以防害蟲傳播。
第六，及時帶有污染物質的如：農藥包裝，殘留過剩的藥液體等多菌物，及時的清理出去，及時進行消耗處理。
在經過以上措施的實施，可以有效的防止雜菌的形成及排放，降低空氣中的雜菌數量，有效的降低防御病害的發生幾率，起到防護作用。