韭菜蟲害主要有韭菜遲眼蕈蚊（韭蛆）、薊馬、蚜蟲、蔥須鱗蛾、潛葉蠅等；病害主要有灰霉病、疫病、菌核病等。針對不同栽培模式的保護地或露地韭菜，防治過程中應明確主要防控對象，采取相應的防控技術。
一、農業措施
因地制宜合理選擇抗性品種；不施用未腐熟有機肥，均衡施肥；韭菜收割后可采取撒施草木灰、地面覆網或覆沙等阻隔措施減少韭蛆成蟲產卵；避免前茬為百合科作物的地塊種植韭菜，實行3年以上輪作，宜水旱輪作；保護地要實施高畦深溝、灌水少量多次，切忌大水漫灌，及時通風降濕，預防灰霉病發生。
二、因地制宜應用高溫覆膜技術
4月底至9月中旬，選擇太陽光線強烈的天氣（光強度超過55000lux），采用“日曬高溫覆膜法”防治韭蛆。早8點左右，用厚度0.10-0.12毫米的淺藍色無滴膜覆蓋（覆膜前1-2天割除韭菜），覆膜后四周用土壤壓蓋嚴實，膜四周盡量超出田塊邊緣50厘米左右。待膜內土壤5厘米深處溫度達到40℃，且持續超過3小時，即可揭開薄膜降溫避免對根傷害。揭膜后待土壤溫度降低后及時大水漫灌，促進緩苗。
三、適時生物防治
防治韭蛆，宜選擇春秋季節、陰雨天氣或早晚陽光較弱時，在韭菜根部噴淋施入每畝1億條左右的昆蟲病原線蟲，再進行澆灌，每年施用2-3次；或在春秋季節低齡幼蟲期，選用球孢白僵菌與細土混勻后撒施在韭菜基部。
預防灰霉病、菌核病和疫病，扣棚前，使用木霉菌或枯草芽孢桿菌，噴霧處理畦壟均勻覆蓋菌劑后再扣棚。扣棚后，待韭菜長到5厘米左右時，噴施枯草芽孢桿菌粉劑（含量大于100億孢子/克，微粉細度800目），每畝噴施100-200克，也可有效防治灰霉病、菌核病等病害。
四、科學合理用藥
嚴禁使用國家和地方明令禁止在蔬菜上使用的高毒、高殘留農藥。交替使用農藥，嚴格遵守用藥劑量、用藥技巧和間隔期的規定。必要時，按照農業農村部《特色小宗作物農藥殘留風險控制技術指標》的要求，科學制定臨時用藥措施。
蟲害防治：防治韭蛆，可選用滅蠅胺、氟鈴脲、噻蟲嗪、噻蟲胺、氟啶脲等藥劑；防治蚜蟲，可選用高效氯氰菊酯、苦參堿等藥劑；防治薊馬，可選用金龜子綠僵菌、噻蟲嗪、乙基多殺菌素等藥劑；防治潛葉蠅，可選用滅蠅胺、高效氯氰菊酯等藥劑；防治蔥須鱗蛾，可選用甲氨基阿維菌素苯甲酸鹽、高效氯氰菊酯等藥劑。
病害防治：在發病前或發病初期，防治灰霉病，可選用腐霉利、嘧霉胺等藥劑以及采取異菌脲、啶酰菌胺等臨時用藥措施；防治疫病，可采取烯酰嗎啉、氟啶胺、氰霜唑等臨時用藥措施。來源：全國農技中心