棉花滴水出苗后，由自養轉為異養（根系吸收土壤養分）經過18-20天營養生長后，棉花生出完整的第三片真葉后，棉花開始花芽分化。
花芽分化是棉花由營養生長向生殖生長的轉變，也是兩種生長并進的開始：主分生理生化和形態分化。
棉花苗期日均溫度19-20℃，6-7天，能順利進入花芽分化始期；
一階段分化：3葉到6葉時（無蕾時），70%為伏前桃，30%為伏桃。
第二階段分化：7葉到9葉時（盛蕾時），70%為伏桃，30%為前秋桃。
第三階段分化：10葉到13葉時，70%為秋桃，30%無用桃。
影響花芽分化的因素：
1、溫度：在分化時，要有一定時期低溫過程，稱為春化作用。
2、光照：光照時間長短也影響花芽分化，分長日照和短日照。
3、激素：人工大量使用高濃度激素也影響花芽分化（蕓苔素，赤霉酸，生長素等）。
促進花芽分化的措施有：
1、中耕：提高地溫，加速營養生長。
2、補充適量濃度的營養葉面肥和鋅，硼肥料，促進棉花營養轉化，（棉花營養生長速度決定花芽分化的數量，花芽分化的花原基數決定棉花生長的高度）。
3、化調：控制細胞分裂素和生長素的產生，增加脫落酸濃度，增大生殖生長轉化。
4、控水：推遲進頭水（出苗55-60天進水），平衡NPK養分用量，促進營養生長和生殖生長同步生長。
根據日生長量來確定上肥量，具體情況如下：
1、正常棉田株高在30-35厘米，日生長量在2厘米左右，這樣的棉田我們可以根據打頂時間倒推出是否需要上水肥提苗。
正常年份打頂時間北疆在7月1日-5日，南疆在7月10日左右，因此北疆還有20-25天的生長時間，機采棉高度一般在75-80厘米，去掉打頂的二葉一心的高度，棉花還需要長50-55厘米。在20-25天這個時間需要讓棉花長這樣的高度，日生長量需要在2.5-2.75厘米，因此日生長量在2厘米就需要進水了。另外20-25天的時間棉花還要長6-8臺果，加上之前的2-3臺就是8-11臺果，打完頂后棉花一般留果枝7-10臺。
正常棉田蕾期到初花需肥大至為尿素6-8公斤，磷肥（一銨）4-5公斤，鉀肥2-3公斤，這就是進入花期時需要的用肥量，新疆進入花期的時間一般在6月25日-7月初之間，需要二至三水的時間，因些前三水可將這些氮磷鉀肥料分次施入。
2、弱苗升級管理
根據棉花打頂時間倒推來，如果棉花現在還沒有現蕾或才剛開始現蕾，株高在10-15厘米，葉片數在5-7片可以認為是弱苗。弱苗需要加大進水頻率，每水都要帶肥，水量夠3-4天用的就可以了，肥料以尿素1-2公斤，二氫鉀0.5-1公斤，5天左右一水，如正常棉田10天一水，弱苗可以五天一水。水前化控縮節胺0.5-0.8克，少量使用，且不可不用或用量過大。
3、旺苗管理
很多農戶在進頭水前棉花還不怎么長，進水后加上這幾天溫度較高，水肥對棉苗的刺激棉苗長勢較猛。有的棉田一天可以長3厘米以上，很多農戶看到這樣的情況就會加大縮節胺的用量，有人一次打3-4克每畝，這樣管理棉花會使葉片變厚，葉片變大，使早現的蕾座不穩。針對這樣的棉田，可少量使用縮節胺，使用2-2.5克每畝，延長進水期，水前3天左右及水后4-5天都進行化控。正常棉田化控一次可以管3-4節，旺長的棉田縮節胺只能管到2-3節，有的甚至無效。因此盡量在頭水前使用縮節胺化控不讓棉花瘋長。
旺長的棉田可根據長勢不滴肥或少滴肥，滴肥時少用尿素，可用二氫鉀0.5公斤或用一銨0.5公斤+鉀肥0.5公斤。
棉花花芽分化期，要根據苗情長勢，采取合理的管理措施，適量進行營養補充和化調，促進前期花芽分化的發育，增多伏前桃和伏桃比例（達到90%以上），確保棉花早發穩長，達到桃多桃重，高衣分，高產量。來源：天山植保