浙農集團不斷加強化肥貨源基地建設，與中化、中農、國投羅鉀、鎮化、寧化、江蘇靈谷、中海化學、浙江巨化、白俄羅斯鉀肥公司、以色列化工集團、美國運安等主要化肥生產和貿易企業建立了長期合作關系。
國產尿素：鎮化，衢化，海南富島，江蘇靈谷，山西晉豐，山東魯南，山東聯盟，華魯恒升，安徽臨泉，江蘇華昌，寧夏寧化，內蒙古蒙化，甘肅蘭化，烏石化，湖北宜化，陜西陜化，陜西渭化，江西九化，山西焦化，遼寧遼化，山東魯西，安徽淮化，安徽臨泉，山西晉城，濟寧恒力等。
國產復合肥：巨化，錢江潮，撒可富，云河系列，云頂，紅三角，艷陽天，施大壯，太倉，環太，金之，中東，金富瑞一銨、二銨，宏福二銨，陜化二銨，山西文通硝酸銨鈣，德陽元豐、天下樂，及公司生產的“惠多利”牌專用肥（水稻、油菜及竹筍專用肥）和通用肥等。
國產鉀肥：濱地硫酸鉀鎂肥，中信國安硫酸鉀鎂，國投羅布泊硫酸鉀，青海鹽湖、藏格鉀肥，山西文通硝酸鉀。
進口化肥：俄羅斯、約旦、以色列、加拿大鉀肥；俄羅斯顆粒鉀肥；俄羅斯、臺灣硫酸鉀、德國紅牛硫酸鉀鎂、德國紅牛氯化鉀硫鎂；俄羅斯、挪威、荷蘭、韓國、羅馬尼亞、芬蘭復合肥；以色列磷酸二氫鉀、水溶性肥料等。
集團公司擁有日趨完善的化肥經營網絡和配套的經營設施，目前已在浙江省內建立了9個連鎖分部、35家區域配送中心和1500多家基層惠多利農資連鎖店；在上海、江蘇、安徽、河南、山東、陜西、湖南、遼寧、江西等十余個省市設有50余家區域性的惠多利連鎖經營服務網絡；在上海、寧波、連云港、青島、湛江、赤灣、滿洲里、綏芬河等口岸設立了辦事處或經營機構；建有22萬平方米的倉儲經營設施。
集團公司與浙江省農科院合作，積極開展測土配方施肥項目，在浙江龍游建立浙江惠多利肥料科技有限公司，生產專用肥系列、通用肥系列、測土訂單配方肥系列、無機+土壤改良劑系列、有機+無機特種肥料系列、控釋肥系列等三十多種產品，年產能30萬噸。在山東、安徽等地建有配方肥生產基地，正逐步形成測、配、產、供、施一體化測土配方施肥系統。