腐爛病是蘋果樹的主要枝干病害，腐爛病一年內，有兩個高峰期和兩個相對靜止期。高峰期出現在3—4月份，此期，果園出現的新病斑數，病斑的擴展速度，都可占到全年總量的70％左右，稱為該病的春季高峰期。5—6月，新病斑很少出現，舊病斑干縮、下陷、邊緣開裂，停止擴展，稱為該病的相對靜止期。7—9月，又有新病斑出現，舊病斑又變軟擴大，進入該病的秋季高峰期。但是，此期的發病量只占全年總量的20％左右。10月份到次年2月，該病又進入一個相對靜止期。病斑刮治是傳統的主要療法。但刮治后的一年至數年，在原病斑的邊緣又發生新病斑，這種現象稱為舊病復發和病斑重犯。使原病斑不斷擴大，危害程度繼續加重，導致了骨干枝和整株死亡，防不勝防。通常病斑復率一般在8%～15%，造成這種現象的原因有：刮治不、不嚴格、缺乏有效藥劑、氣候因素等。
蘋果樹腐爛病菌是一種弱寄生菌，蘋果樹的樹齡多數在15年生左右，有一部分已在20年以上，果樹腐爛病發生呈逐年加重趨勢，部分區域已經進入腐爛病的嚴重發病期，必須引起高度的重視。
一、加強綜合管理，增強樹勢
要合理負載，調節結果量，避免大小年。第二要合理施肥，8月下旬—10月上旬在樹上進行葉面噴肥，在樹下拖入有機肥和無機肥，可明顯增加樹的營養積累，提高樹體的營養水平，明顯壓低第二年春季高峰的嚴重程度。增施鉀肥和磷肥，可明顯提高樹體對腐爛病的抵抗能力。第三要合理修剪，避免造成過多過大的傷。腐爛病菌是從傷口侵入的，尤其是帶有死組織的衰弱傷口易感染腐爛病。因此，對剪口、鋸口、日口一定要及時涂藥或包泥。第四要保葉促根。防治導致早期落葉的病害和蟲害，如褐斑病、紅蜘蛛、潛葉蛾等，是培養壯樹的主要環節。加強樹下管理，促進根部發育，對培養壯樹十分重要。要保護好樹葉，嚴格疏果，合理負載，禁止環剝，克服“大少年”。并做到細致修剪，合理留枝，樹體健壯。
二、及時病菌
腐爛病菌主要存在于枝干病斑內外、枝干上的落皮層（粗翹皮）、傷口（剪口、鋸口、蟲傷、日、等）、皮下干斑、枯樁干橛等部位；枯死的芽眼、葉痕、皮孔也有腐爛病菌。病菌的有效措施：要認真搞好果園衛生。及時去除病死枝、刨除病死樹、腐爛病斑，不在園內堆積樹枝，刮除粗翹皮等，減少果園內病菌數量。第二要進行藥劑的防治。適時使用有效藥劑，殺滅枝干表面病菌和潛伏侵染病菌，降低果園菌量，控制病害發生是藥劑防治的根本目的。
病源。病源，是防治腐爛病的基礎措施。因此，要作到定期檢查，細致刮治，病源。刮治時，先將病斑涂上藥劑，在樹干周圍要鋪上塑料布，收集病皮，防止落地。病斑應切成直茬、菱形，周圍要切去2～4毫米的好皮，清凈帶毒木質，以防遺留病菌，造成復發。刮除病皮后，用43%真彩（戊唑醇）SC300倍或25%斑迪力（丙環唑）EC500倍或30%潔苗（丙環唑苯醚甲環唑）EC500倍涂抹病疤，并對刀具進行。后對病疤涂愈合劑和康復劑進行封閉保護，可以使用PAVC（聚乙酸乙烯酯系）乳液。四五月份中下旬要再進行1次。以后檢查當年的病疤和兩年以內的病疤，六、七、八月份要各涂1次劑，控制病斑復發。
搞好重刮皮。夏季在果樹生長期對蘋果樹枝干進行重刮皮，減少病菌侵染擴展及致病機會，可及早和有效地防止腐爛病疤復發。具體方法是在樹體愈合能力強的6～8月份，選擇雨后晴天，用鋒利的刮刀將主干、主枝基部樹皮的表層刮去1毫米左右活組織。刮時要注意檢查舊病疤和刮凈病變組織，對樹杈和樹皮較薄的部位要細心刮，防止刮透樹皮，刮后不要涂藥，以利愈合。早春和晚秋或天氣干旱時不宜進行，以免愈合不良，削弱樹勢。
三、科學使用化學農藥
1、要選擇有效藥劑。要想殺滅枝干內外的病菌，所有藥劑必須具備條菌能力強，譜廣，有極強的滲透性或內吸性的特點。同時，兼治其它病蟲、無污染、，符合無公害果品生產要求。過去的使用經驗證明，石硫合劑、硫懸浮劑等不具備浸透性的藥劑效果較差；福美砷等砷制劑雖然效果較好，但它污染環境，不符合無公害果品生產要求，已被農業部明令禁用，請不要再推廣使用。43%真彩（戊唑醇）SC力強，譜廣，有極強的滲透作用，對腐爛病防治明顯，能夠促進各種傷口形成愈傷組織，低毒、、不污染環境，符合無公害果品生產要求，可以稱之為當前為適用的劑，作為替代砷制劑的品種。
2、準確掌握用藥時間和技術。蘋果樹腐爛病防治時期為落葉后和發芽前，即秋末冬初（11—12月，此時用藥當年侵染的腐爛病菌剛在樹皮淺層定殖，較易殺滅，此時噴藥，效果）和第二年發芽前（3月中旬—4月上旬噴藥，也可滲入樹皮，殺滅病菌，也有一定效果）。落葉后和發芽前這個時期可分別噴一次43％真彩（戊唑醇）SC3000倍液，落花后，氣溫升高，病菌開始活動，如果在5—7月份再用43％真彩（戊唑醇）SC300倍液涂刷主干及骨干枝1—2次，也可殺滅一部分潛伏侵染的病菌。可以明顯控制腐爛病的危害。
3月份發芽前噴43%真彩（戊唑醇）SC3000倍或25%斑迪力（丙環唑）EC4000倍或30%潔苗（丙環唑苯醚甲環唑）EC5000倍。殺死潛伏于枝干傷口、病斑及侵入表皮的病菌。生長期六、七、八月份噴藥防治其他病害時，正是蘋果腐爛病菌大量傳播、侵染期，每次噴劑時，都要強調周密噴好枝干。對易發病的剪鋸口、枝杈處、舊病疤等部位，特別要噴透，對防止和預防腐爛病復發具有良好效果。
蘋果摘袋時期因樹種、品種和紙袋類型而異。紅富士等蘋果品種采前15-25天前后摘袋;豐水、新高、黃金等梨品種采前無須摘袋;桃品種一般在采前15天左右摘袋;套葡萄半透明袋的采前不須摘袋，套紙質較厚紙袋的在采前10—15天摘袋。摘袋選擇在陰天或多云天氣進行，若晴天摘袋一般宜選在日出后果實溫度與外界溫度基本相同時進行，即每天中午之前或之后的一段時間內進行。時間基本同套袋，以上午9時半至下午4時前為好，應避開午間光照強期，上午宜摘樹北側袋，下午宜摘樹南側袋。