按菌種的組成可分為：單一菌劑（一種微生物菌種制成）和復合菌劑（兩種或以上互不拮抗的微生物菌種制成）；
按功能類型可分為：固氮菌菌劑、根瘤菌菌劑、硅酸鹽菌劑、溶磷微生物菌劑、光合菌劑、菌根菌劑、促生菌劑、有機物料腐熟菌劑、生物修復菌劑。
微生物菌劑的作用
1、提高作物產量
有效菌可以分泌赤霉素、細胞分裂素、生長素等物質，可以刺激、調節、促進作物的生長發育，利于作物增產。
2、改善作物品質
分解、釋放多種中微量元素，可以使作物更好的吸收，提高作物體內蛋白質、氨基酸、糖分等含量。
3、增強作物抗逆性
有效菌可以分泌多種抑菌物質、類物質和多種活性酶的功能，可以抑制或者殺死多種土傳病害，降低病害發生的概率，增強作物抗旱、耐寒、抗倒伏及抗鹽堿能力等，還可以有效預防作物生理性病害的發生。
4、提高化肥利用率
有效菌可以分解土壤中的有機質，并且生成腐殖酸可與土壤中的氮形成腐殖酸銨，減少氮肥流失。葉虹時光微生物菌劑還具有很好的解磷、解鉀的作用，可以將土壤中無效態的磷、鉀轉化為有效態的磷鉀。
5、改善土壤環境
有效菌可以促進土壤中難溶性養分的溶解和釋放，提高土壤養分供應能力；分泌的胞外多糖可以增強土壤的團粒結構，疏松土壤，提高土壤通透性和保水保肥能力，增加土壤有機質的含量，改善土壤養分供應狀況。
微生物菌劑為何能使
土壤“藥到病除，恢復健康”？
● 首先，微生物是真正意義上的土壤的“造就師”
微生物通過代謝過程中氧氣和二氧化碳的交換以及分泌的有機酸等酸性物質，促進土壤中微量元素的釋放及螯合，有效打破土壤板結，促進團粒結構的形成，并能改善土壤的通氣狀況，促進有機質、腐殖酸和腐殖質的生成。對應于當前土壤中出現的通透性不強、保水保肥性 差、地力差等問題，正是受土壤中的團粒結構、有機質、腐殖酸和腐殖質的影響，而這些物質的形成又受土壤中微生物的作用。
● 其次，微生物是土壤的“養分轉化師”
微生物在土壤中物質和能量的輸入輸出中扮演著非常重要的角色，是物質循環鏈上的重要環節。它能夠活化土壤有機與無機養分，分解有機物，釋放養分，增加養分的有效性。對應于當前土壤中出現的板結、酸化、鹽漬化、土壤貧瘠、地力衰竭等問題，這些問題出現的原因是肥料在土 壤中長期積累、殘存、得不到有效分解和營養轉化，養分的釋放和轉化正是靠微生物。
● 再者，微生物是土壤的“清潔師”
微生物在其繁殖和代謝過程中，可以降解土壤中殘留的化肥、有機農藥、重金屬和其他污染物等，在其理化反應中對上述污染物質進行分解、轉化、固定、轉移以及新的化合成，把他們分解成低害甚至的物質，降低土壤污染的程度。
此外，土壤中的微生物，例如抗生性微生物，它們能夠分泌，抑制病原微生物的繁殖，這樣就可以防治和減少土壤中土傳微生物對作物的危害，提高作物品質和產量。
當前，恢復土壤健康已經迫在眉睫，如果惡況再繼續發展下去，我們將無地可耕、無糧可食、無水可飲、無衣可穿。微生物是土壤的重要組成部分并且是土壤生態系統的靈魂和中心，必將在土壤健康的恢復中發揮重要作用
作物選擇采果肥該何去何從
未經腐熟的有機肥中，攜帶有大量的致病微生物和寄生性蛔蟲卵，施入農田后，一部分附著在作物上造成直接污染，一部分進入土壤造成間接污染。另外，未經腐熟的有機肥施入土壤后，要經過發酵后才能被植物吸收利用，否則既會產生高溫造成燒苗現象，又會釋放氨氣，使植株生長不良。因此，在施用有機肥時一定要腐熟。
想要讓“有機肥”成為優質的有機肥，需要使用微生物菌劑，通過有氧及厭氧發酵，發酵堆可快速產生高溫，可殺死有害菌以及有害蟲和卵。補充有益菌，可顯著提高土壤氮素、有效磷及鉀等，肥料質量好。
根是作物的關鍵所在，土壤是根的生長環境。一個好的土壤環境可以讓根部生長健康，一個好的根可以讓作物生長健康。所以，大家要學會愛護土壤，改善根部環境。
秋施基肥有四大好處。
一是土溫比較高，土壤中微生物活動頻繁，此時施基肥，能夠更好的分解、轉化，提高肥料的利用率；
二是迎來了獼猴桃根系生長的***后一個高峰期，此時施肥，能夠發揮根系的吸收和合成、轉化的功能，對于掛果受累或者夏季枝條旺長的樹體來說，能夠在獼猴桃落葉休眠之前，增加樹體的儲備養分；
三是氣溫比較合適，樹體距離落葉的時間還有1個多月，利用這段時間，促使葉片提高光合速率，促進花芽、葉芽的分化，促進來年花芽飽滿，提高坐果率，為來年樹體生長發育打下良好的基礎；
四是，施基肥的同時，必然會造成斷根，此時根系繁殖能力強，傷口愈合快，而且能夠促發新生根，增強根系活性，促進營養的進一步吸收和轉化。