食用菌對人體是非常健康的，在崇尚健康飲食的理念下，人們選食用菌當食材也越來越普遍，那么種植時也更應該好好地管理，讓它為我們帶來更多的經濟價值。當種植食用菌的菇棚里出現了病蟲害就要及時地去用農藥。以下方法敬請參考：
使用合適的農藥對癥：一是農藥要對癥，針對生產中發生的病害種類，采用對癥農藥殺滅。在實際生產中，不少菇農不管什么病害，也不論是否對癥，只要聽說是殺菌的，拿來就用，往往因藥不對癥，而延誤了防治時機，使得“小病變大病，大病成絕癥”。二是農藥用量要適當，不可過量用藥。一般播種前堆料及菇棚物料消毒用藥范圍和濃度相對大一些，播種后及出菇前用藥濃度要嚴格控制在范圍之內，子實體階段濃度應更低一些。如用辛硫磷加殺螨劑防治螨類害蟲，堆料至出菇前用500倍液，而子實體階段必須用藥時應降低濃度為1000倍液。
要選擇使用高效低殘的農藥，指要選用高效低毒低殘留的農藥，禁用劇毒農藥。常用的殺菌劑有多菌靈、百菌清、克霉靈、代森鋅、甲基硫菌靈、波爾多液、石硫合劑和硫黃粉等；常用的殺蟲劑有辛硫磷、敵敵畏、敵百蟲、殺滅菊酯、磷化鋁、殺螨特等。也可使用微生物制劑。無論是拌料、堆料或是菇棚防治，嚴禁選用劇毒、殘留期長的有機汞、有機磷類農藥。不同農藥交替施用可避免病菌、害蟲產生抗藥性而降低藥效。