生物農藥以低毒、、作用遲緩、持效期長的優點深受人們喜愛。配比濃度和使用劑量都比化學藥劑底低，藥量稍大時不至于對植物產生藥害，對人畜也較，且不污染環境？茖W使用生物農藥，限度地利用有利因素，避免不利因素。
1、不同生物農藥品種防治對象不同
在生物農藥的實際應用中。不少人對生物農藥的性質還不完全了解，誤認為生物殺蟲、殺菌劑可防治一切病、蟲害，而不加選擇地普遍使用，這樣不但收不到應有效果，而且還會延誤防治時期。生物藥選擇性很強，如蘇云金桿菌（Bt）對防治鱗翅目幼蟲有效，但對同翅目的葉蟬就沒有致病性，而且蘇云金桿菌的不同品種系對幾種重要害蟲的防治效果也存在著差異。另外，要根據害蟲取食特點使用不同類型的生物農藥，如Bt對鱗翅目害蟲效果很好，噴灑后會分布于植物表面，使害蟲取食或觸菌死亡，但對刺吸汁液的害蟲（如蚜蟲、螨類）無效，而阿維菌素對螨類殺傷效果非常好。因此，應針對不同種類害蟲有針對性地選擇適合的生物農藥品種。使用生物農藥，提倡用兩種或兩種以上配合使用，預防期和持續用藥情況下完全可以單獨使用一個藥種，但在病蟲害高發期不宜單獨使用。
2、選擇適宜的生物農藥劑型
生物農藥的防治效果往往與劑型和使用技術密切相關，使用時要根據防治對象、氣象條件和使用時間，正確選擇適當的劑型，才能達到防治效果。如粉劑可借助空氣浮力和風力分散于較大范圍，從而和害蟲有更大接觸；對于食葉量很大的害蟲，可采用將可濕性粉劑加水配成懸浮液的方法噴霧效果較好，而采用噴粉法效果較差。膠囊劑不僅有較長的釋放效果。而且能保護其中的病原體不受環境因素的影響。可用于大棚撒施。
3、確定適宜的防治時期
生物農藥作用緩慢，宜在害蟲低齡幼蟲期使用。許多生物農藥殺蟲效果緩慢，比不上化學農藥，噴喉立竿見影。因此，用藥時間應比化學農藥提前2-5天。如BT乳劑，白僵菌等，一般噴藥后，害蟲3-5天才逐漸死亡。
4、要注意噴藥的氣候條件生物農藥的使用效果受環境因素的影響較大
4.1溫度。生物農藥在噴施時，務必控制在理想的20℃適溫以上，其奧妙在于這類農藥的活性成分是由蛋白質晶體和有生命的芽孢所組成，一旦在低于上述溫度下噴施，那么芽孢在害蟲機體內的繁殖速度十分緩慢而且蛋白質晶體也很難發揮其作用，往往施后顯不出防治效果。據試驗資料表明，在溫度25-30℃條件之間，噴施后的生物農藥效果要比在10-15℃之間的殺蟲效率高出1-2倍。
4.2濕度生物農藥對濕度的要求也極為敏銳。環境濕度越大噴施生物制劑農藥的藥效越顯著，特別是對粉狀生物制劑農藥尤為明顯。
4.3陽光太陽光中的紫外線對芽孢有著致命的殺傷作用，科學試驗表明，陽光直射30分鐘，竟會使芽孢一舉殺死50％，照射1小時后，其芽孢死亡率卻高達80％，而且紫外線的輻射對伴孢晶體還能產生變形降效作用，因此要選擇在午后4點鐘以后或者陰天使用效果會大大發揮。
4.4雨水芽孢怕大暴雨沖刷，所以要根據天氣預報進行，因為暴雨會將噴施的菌液沖刷掉，失去殺傷力。如果噴施后（5-6小時后）遇到下雨（小雨），不但不會降低藥效，反而可提高防效作用，原來小雨對芽孢發芽大為有利，害蟲一旦食后就加速其死亡。
5、適宜的噴霧器械
多數生物農藥無內吸性，噴藥時要注意噴撒均勻才能起到良好效果，在實際應用中，目前大多數植保器械使用效率都較低，通常是由上而下直接對作物噴霧，使大量農藥都聚集在作物上面的葉片上，作物中下部葉片上附著的農藥較少，飄落損失在土壤表面的較多。如果霧滴大時，損失就更。由于生物農藥生產成本高，故要選擇噴施效率高、霧化程度好、節省農藥的植保器械。如彌霧噴粉器、彌霧噴霧器等。
6、生物農藥的混配
①生物殺蟲劑的混配：生物殺蟲劑與多數化學殺蟲劑濁混配，因多數化學殺蟲劑都呈化學酸性、生理中性，對細菌、真菌沒有抑殺作用和中合反應，因此可以充分混配。由此可知，生物殺蟲劑不可與化學殺菌劑混配，一旦混配，生物藥劑的活性細菌孢子會遭到扼殺失去其應有的效力。②生物殺菌劑的混配：生物殺菌劑可以和多數化學藥劑、生物藥劑混配，但不可與堿性混配，只有少數藥種不可與酸性藥劑混配，如木霉菌類藥劑可以與多數生物殺蟲劑和化學殺蟲劑同時混用。
7、生物農藥隨配隨用
使用時要隨配隨用，配好的農藥一次用完，如白僵菌，配好的農藥要在2小時內噴完。以免孢子過早萌發，失去效力。
8、生物農藥貯藏
溫馨提示：生物農藥貯藏的地點要求陰涼，干燥，避免受潮失效。例如，蘇云金稈菌，井崗菌素等，它們的特點是不耐高溫，不耐貯藏，容易吸濕霉變，失活失效，而且保存期不能超過2年。