晚種麥的特點，一是基肥少，秋前積攢的肥料主要施在早、中標上，雙季稻區的稻被麥，因為搶時間播種，往往顧不上施肥，故土壤缺肥；二是播期遲，氣溫低，土壤中有限的養分也不能及時供應麥苗需要；三是扎根較淺，即使施了底肥，一時也吸不到。因此，要在麥子出苗以后，特別抓緊早施苗肥肥料“吊苗”，促早榮，快分粟，趕上早麥長勢。
晚麥早施苗肥應以腐熟人畜類尿為主，適當搭配統、磷肥。抓緊在三葉期前，一般每畝施人畜糞尿10一20招，并加標準氮素化肥8—10斤，過磷酸鈣20斤左右。施后抓緊中拼松土，提高地溫，提高苗肥的效果。
晚麥施苗肥要早，但不能過多過猛。因為冬季氣溫低，晚麥論小，吸肥力弱，追肥過多一時吸不了，還不如留一部分肥料在麥茁返育到拔節前后施用效果更好。