成立于1958年的北京市農林科學院位于風景秀麗的昆玉河畔，西倚北京西山，東臨京密運河，交通便利，環境優美，全院占地面積1370畝，各類建筑物29萬多平米，資產總值10億多元。經過50年的建設，已經發展成一所主要承擔農業應用基礎、應用及開發性研究，農業高新技術研究，農業科技成果轉化等任務，學科齊全、設備先進、學術水平較高、產業能力較強，為北京農業發展提供強有力科技支撐的地方綜合性農業研究機構。
目前，我院下設蔬菜研究中心、林業果樹研究所、畜牧獸醫研究所、水產科學研究所、植物保護環境保護研究所、植物營養與資源研究所、農業科技信息研究所、農業綜合發展研究所、北京農業信息技術研究中心、北京農業生物技術研究中心、雜交小麥研究中心、玉米研究中心和北京草業與環境研究發展中心、農產品質量檢測與農田環境監測技術研究中心等14個研究所（中心），擁有4個工程技術研究中心、4個農業部原種基地及資源圃、5個農業部高技術實驗室及中心、10個北京高技術實驗室和專業研究中心。
五十多年來，在人才隊伍建設方面，我院推行了全員聘用合同制、全員年度考核制度和專業技術崗位聘任制（試點），按照“公開、公正、平等”的原則實行新進人員公開招聘制度，設立了鼓勵青年專家脫穎而出的青年科研基金和科研獎勵基金等制度。全院現有從業人員1850人，其中高級專業技術人員 282人、博士（后）201名、碩士300名；擁有博士后工作站1個，博士生培養點5個，碩士生培養點7個。另有25人入選國家或北京市“百千萬”人才工程、19人獲得北京市青年知識分子稱號、24人入選北京市突出貢獻專家、63人享受北京市政府特殊津貼、127人入選北京市科技新星培養計劃。全院45歲以下的青年科研骨干占80%以上，基本形成了以中青年人才為主，老中青相結合的人才梯隊。
“創新與服務”是我院的立院之本。我院已經走過了50年的光輝歷程，特別是改革開放以來，在北京市委市政府的正確領導下，我院各項工作重心緊密圍繞北京農業的功能和定位不斷調整，以科技創新為出發點，以服務郊區為落腳點，大力傳承“求實創新、團結奮進”的農科精神，通過幾代人的辛勤努力，建成了包括動植物種質創新與新品種選育、農業信息技術、水產科學、工廠化農業、生物防治、禽病防治、環境友好型肥料、都市型現代農業發展研究等優勢學科在內的綜合性農業科研體系。在為北京市農業發展提供重要的科技支撐的同時，也為全國農業科技進步和農業現代化建設做出了較大貢獻。
“十一五”以來，我院累計承擔國家和市級項目近500項。獲得省部以上各類科技成果獎勵82項，其中獎勵6項；神農中華一等獎2項，市科學技術一等獎2項，市農業推廣一等獎13項。獲得國家發明和實用新型專利授權94項，獲得新產品保護、新獸藥證書16個。發表SCI和EI論文154篇。
50年來，我院將科技創新成果不斷的應用于農業生產實際當中，為農村經濟的發展提供的科技服務。蔬菜研究中心選育的47個大（小）白菜新品種在全國28個省市得到推廣應用，2009年獲得農業部神農中華一等獎；培育的京欣、京玉系列西甜瓜品種成為了北京市場的主栽品種，累計推廣面積達56萬畝，為農民增收2億多元；經過50年幾代林果專家的不懈努力，培育出的桃新品種達40個，為平谷大桃產業化發展與升級奠定了堅實的基礎；我院大力開展的以精準農業、智能化溫室設備、農業專家系統為代表的現代農業信息技術達到世界先進水平，其成果不但在全國得到了大范圍推廣應用，而且推廣到東南亞等地；研發的以生物防治技術、有機農業生產技術、新型肥料、循環農業技術為代表的都市型現代農業生產技術在京郊及周邊得到廣泛推廣；研發的農民遠程教育培訓系統在全國建立遠程教育站點628，其中北京市436個，實現了京郊遠程教育鄉鄉通，并開始進村入戶，有力地提高了農民的科技文化素養。開放辦院，加強與外界的交流與合作，使我院的科技創新與服務水平進一步提升。通過與區縣建立全面科技合作，促進了大興西甜瓜、平谷大桃、房山食用菌、密云板栗等區域產業的發展與升級，為當地農民增收、農業增效、農村可持續發展提供了有力的科技支撐。目前，全院有200多名專家長期在京郊近400個基地進行科學試驗和成果的示范推廣，不斷把新成果、新技術、新產品、新工藝送到農民手中，有力地促進了農業科技成果的轉化步伐。