冬季辣椒育苗期間，往往會受到突然寒流的襲擊，溫度驟然降低，秧苗容易受凍害。如果溫度是緩慢降低，則不易結冰受凍。如果溫度雖然不太低，但低溫持續時間很長，特別是低溫與陰雨相伴隨的這種情況即“濕冷”，秧苗也很容易發生凍害。秧苗受凍害的輕重，還與低溫過后氣溫回升的快慢有關。若氣溫緩慢回升，秧苗解凍也慢，易恢復生命活力。如果升溫和解凍太快，秧苗的組織便易脫水干枯，造成死苗。

有效防凍方法有如下幾方面：1、改進育苗方法：利用人工控溫育苗方法，如電熱溫床和工廠化育苗等，是解決秧苗受凍問題的根本措施。2、增強秧苗抗寒力：避免秧苗徒長，低溫寒流來臨之前，盡量揭去覆蓋物，讓苗多照光和接受鍛煉。在連續雨、霜、低溫期間，也要盡可能揭掉草簾，每天至少有1－2小時讓苗照到陽光。雨霜停后猛然轉晴時，中午前后要在苗床上蓋幾塊草簾，避免秧苗失水萎蔫。若床內濕度大，秧苗易受凍害。所以寒潮降臨之前要控制苗床澆水。床內過濕的可撒一層干草灰。

3、合理施肥：噴施愛普諾藻藍蛋白。合理噴施愛普諾藻藍蛋白2-3次，可調節辣椒抗逆性，使秧苗抗寒抗旱，并且可以防治病害。4、保溫防凍：寒潮期間要嚴密覆蓋苗床。進行短時間通風換氣時，要防止冷風直接吹入床內傷苗。夜晚要加蓋草簾。有的將稻草外層枯葉撒在床內秧苗上，寒潮過后再。

苗床上蓋的草簾應干燥。下霜天停霜后，及時將霜出育苗場地。