這些年來，我國大棚蔬菜的發展速度十分迅速，其栽培面積大幅度擴大，但是由于大棚的環境與露天有所不同，所以其病蟲害的發生那個也較為頻繁，想要生產出優質的蔬菜，科學正確的防治大棚蔬菜病蟲害就尤為關鍵。
由于大棚蔬菜所生長的環境中，其日光、溫度、濕度、等各方面條件都是其它種植環境與眾不同，而對應的其病蟲害的發生條件和生存條件同樣有所改變，所以對大棚蔬菜病蟲害的防治要做到一下幾個方面：
首先要正確選藥，輪換用藥。因為每種農藥都有其特定的防治對象和防治范圍，所以在用藥前要充分了解大棚蔬菜病蟲害的發生情況和環境條件，正確選擇其對應的農藥，又因為單一用藥會促使其產生抗性，所以要盡可能的選用作用機制不同的農藥進行輪換用藥。
比如殺蟲劑的有機磷制劑、擬除蟲菊酯類制劑、氨基甲酸酯制劑、有機氮制劑、生物制劑、昆蟲生長調節劑、除草劑等其作用機制各有不同。如果菜蚜對樂果產生抗藥性，就不能在使用敵敵畏，因為菜蚜也會對敵敵畏產生抗藥性，但可以選用吡蟲啉類。蔬菜一產生抗性的苯并咪唑類殺菌劑（多菌靈、托布津等）、類殺菌劑等內吸殺菌劑，可以同不一產生抗性的代森類、無機硫制劑類、銅制劑類等接觸性殺菌劑輪換使用。
其次，適時用藥。由于大棚內環境條件的會影響到藥效，所以要在合適的時期用藥，不能再高溫下使用硫制劑防治瓜類及蔬菜病害；而在冬季利用煙霧劑防治大棚蔬菜病蟲害，利用農藥氣化后冷凝成煙霧顆粒或直接把農藥分散成姻霧粒防治病蟲害，有著不錯的效果。
再次，混合用藥。同樣是針對大棚蔬菜抗藥性，如果大棚蔬菜病蟲產生了抗性，那么混用農藥將會成為十分有效的手段，如瑞毒霉和代森錳鋅混用、有機磷劑與菊酯類混用，殺螨劑與其它殺蟲劑混用，殺蟲劑與殺菌劑混用。但是在大范圍使用混合藥劑前一定要進行小范圍的實驗，而且，同樣不能長期使用，否則也會產生抗藥性。
，合理正確用藥。在蔬菜生產中應選用高效、低毒、低殘留的生物農藥品種，有機類的的菊酯類、部分中、低毒性的有機磷、有機硫等殺蟲劑、殺菌劑及部分中低毒性的二苯醚類除草劑等等。如：氯氰菊酯、溴氰菊酯、樂果、敵敵畏、辛硫磷、多菌靈、百菌清、甲霜靈、粉銹寧、撲海因、甲硫菌靈、抗蚜威、禾草靈、稀殺得、禾草克、果爾、都爾等。而高殘留的有機氯類農藥、二次中毒的氟乙酰胺、代謝物為“三致”物的乙撐硫脲等諸類農藥一定要避免使用。無機類的硫制劑、銅制劑、磷化物，如硫酸銅、波爾多液、石硫合劑、磷化鋅等。同時生物源農藥也是十分不錯的選擇，其包括植物源農藥、動物源農藥和微生物源農藥。如：BT、除蟲菊素、煙堿大蒜素、性信息素、井崗霉素、農抗120、瀏陽霉素、鏈霉素、多氧霉素、阿維菌素、蕓苔素內脂、除螨素、生物堿等。