從6月1號開始，磷酸一銨、二銨的出口首先踏入低關稅期，在基準價以下執行7%的低關稅；7月1日開始，尿素出口也進入低關稅期，同樣也是基準價以下，執行7%的低關稅。相比于現在110%的高出口關稅，低關稅期的稅率大大降低，這對出口很有利，許多人對化肥出口充滿了期待。但從目前的情況看，化肥出口面臨兩只“攔路虎”。
一是出口基準價是否含稅。目前的化肥出口政策為，旺季出口征收110%出口關稅；淡季時，當出口價格不高于基準價格時稅率為7%，當出口價格高于基準價格時稅率為(1.07-基準價格/出口價格)×100%，尿素、磷酸一銨、磷酸二銨的出口基準價分別為2100元（噸價，下同）、2900元、3400元。
3月23日，氮肥工業協會會同國內數家大型尿素生產企業赴財政部、發改委匯報。當時傳出的消息是，財政部就淡季尿素出口價進行了解釋，認為今年執行的基準價應為不含稅的價格，并表示日后會向海關做出解釋。據測算，尿素含稅與不含稅價格相差大概144元左右。如果認為基準價不含稅的話，相當于尿素出廠價在1900～2000元，也能享受到7%的低關稅，如果認為基準價是含稅的話，那么合算起來尿素出廠價只能在1760～1850元，現在尿素生產成本普遍在1800元以上，這顯然對尿素廠家不利。就在大家以為基準價不含稅是板上釘釘的時候，卻傳出消息說海關不同意，并且迄今為止確實也未看到有基準價不含稅的新文件出臺。
基準價是否含稅目前還未有最后定論，相對而言，對尿素的影響比磷銨大。磷銨出口目前利潤狀況較好，如果基準價含稅只不過是減少一些企業利潤罷了。而按照目前的國際市場價格，尿素正好處在可出口可不出口邊緣，如果含稅的話，有可能嚴重影響到出口量，影響相對比較大。
二是人民幣升值問題。4月29日，人民幣兌美元中間價報6.4990元，首次突破6.50元整數關口，再創匯改以來新高。自去年6月第二次匯率改革以來，人民幣兌美元累計升值約5%，今年第一季度人民幣兌美元升值幅度達1.3%，4月累計升值0.88%，創下年內月度升值新高，人民幣升值呈加速之勢。
人民幣升值對出口不利，例如，4月初時人民幣對美元匯率在6.55左右，今后如果升值到6.45，尿素出口離岸價為350美元，那么匯率損失就達35元，基本上是人民幣每升值1%，出口利潤就要減少1%。人民幣升值速度過快，對出口影響是非常大的。
不過出口的關鍵問題還在于國際價格，如果國際價格較高，上面這兩個問題都可被忽略掉。據測算，如果我國的尿素出口離岸價能達到370美元以上，則出口會相當順暢，那時基準價問題、人民幣升值問題就不會再是大的問題。目前國際尿素價格已逐步走出低谷，最近三周連續出現上漲，波羅的海地區離岸價從前期最低310美元上漲到了目前的350～360美元，這對尿素出口是個好事；國際磷銨價格則一直在高位盤整。總體來看，我國化肥出口還存在著一定機會。