蔬菜苗期的主要病害有猝倒病、炭疽病、立枯病、霜霉病等幾種。據調查，由于管理不善而發病株率為15%-20%左右，個別嚴重的達60%以上。抓好蔬菜苗期病害的防治，是確保當年蔬菜生產的重要措施。現將幾種主要苗期病害識別及防治方法介紹如下。
猝倒病
主要危害黃瓜、辣椒、茄果類、萵苣等蔬菜幼苗，由病原真菌的腐霉菌引起。從種子發芽到幼苗出土前染病，造成爛種爛芽；苗期發病，幼莖多在近地表處出現淡褐色水漬狀斑點，病部迅速發展繞莖一周，逐漸濕軟，縮成線狀，表皮脫落，使幼苗依然青綠而折倒，故稱為猝倒病。然后病苗腐爛或干枯，苗床濕度大時，病苗或臨近土表長出一層白色棉狀菌絲體。
炭疽病
主要危害瓜類、辣椒等。危害瓜類的炭疽病，直接使莖基部黑褐而萎縮、引起幼苗倒伏。首先多發生在子葉邊緣，呈褐色半圓形病斑；成株期葉片上出現近圓形紅褐色病斑。而辣椒的炭疽病，初期葉片出現褪色水漬狀病斑，以后擴大成褐色，中部稍呈灰褐色病斑，并在同心輪紋上生黑色小點。一般氮肥施用過多，排水及通風不良、連作等發病嚴重。
立枯病
由病原真菌絲核菌侵染危害所致。為害對象與猝倒病相同，幼苗在出土時易受害，開始在莖基部產生橢圓形褐色凹陷病斑，初期白天葉片萎蔫，晚上恢復，病斑擴大繞莖一周時，幼苗開始干枯，但立而不倒，當濕度大時病部產生褐色菌絲。
霜霉病
主要危害瓜類、瓠子及萵苣葉片，一般中下部葉片先發病，初期葉片出現水漬狀綠色斑點，并逐漸發黃，繼而呈多角形淡黃色至黃褐色病斑，嚴重時葉背病斑長出灰綠色黑斑，進而布滿全葉枯死。
灰霉病
不同種類的蔬菜亦有差異，辣椒發病葉子先端發黃，后發展到子葉的幼莖，莖部產生褐色或暗褐色不規則形病斑，幼苗自莖部折斷而死。在潮濕條件下，病部長出灰色霉狀物。番茄幼苗受害部位溢縮，腐爛，病部表面亦有灰色霉狀物。
根腐病
主要由疫霉菌危害所致，在高溫高濕地易發生。番茄發病初期莖基部或根部產生褐斑，逐漸擴大后凹陷，嚴重時病斑繞莖基部或根部一周，植株幾天后枯萎而死。縱剖莖基部或根部，會發現導管變為深褐色，后期根莖腐爛，不再長新根。辣椒根腐病由腐皮鐮孢菌危害所致，在定植后，主根及根莖下部皮層發病初期呈淺黃色，而后變軟呈淺褐色腐爛，與側根隔斷，腐爛后根皮極易剝離，露出暗色的木質部。
枯萎病
主要危害瓜類的蔓和根。病斑初為褐色水漬狀，繼而病莖變細，逐漸干腐，根部腐爛。初期病株白天萎蔫，夜間恢復，反復幾天后植株枯死，切斷病莖可見莖內維管束變成褐色。
苗期病害的防治措施
1、選好苗床
應選擇背風向陽、地勢高、水位低，排水良好的地塊做苗床，盡量是連續3-5年未種過茄果類、瓜類及十字花科蔬菜的大田作苗床，土質以沙壤為好，并且要注意選擇13-17厘米以內的表層土，忌用園土作苗床。
2、種子處理
用綠亨天寶1500倍液浸種，不需浸種的可將藥液濕淋在種子表面邊噴邊拌，充分拌勻，以種子濕透為止，可提高發芽率，促進發根，增強幼苗抗寒能力，防止漚根。藥劑拌種用藥量，每2公斤種子用綠亨一號1-1.5克，或用綠亨二號3-4克。拌種方法有兩種：干拌。將藥劑加少量過篩細土摻勻后，加入種子充分拌勻。濕拌。用少量水將種子均勻濕潤，然后加所需藥量拌勻。拌種用拌種桶，每次拌種量不超過半桶，每分鐘20-30轉，正倒轉各50-60次，充分拌勻，拌后隨即播種，不需悶種。
3、做好苗床土壤消毒
如苗床建在重茬地或使用舊苗床時，須用藥劑處理床土。可用50%多菌靈、50%福美雙、40%拌種雙等，每平方米用藥量8-10克，先將農藥與適量細土混拌均勻，取1/3藥土均勻撒到苗床土上或播種溝內，其余2/3藥土蓋子播下的種子上，然后覆土。要保持床面濕潤，以免發生藥害。也可用福爾馬林消毒床土，方法是每平方米床土用40%甲醛（福爾馬林）消毒床土，福爾馬林30毫升對水60-100倍液噴灑。然后用塑料薄膜將床土表面蓋嚴，悶4-5天后除去覆蓋物，耙松放氣2周以上進行播種。
4、營養土消毒
在連續多年種植蔬菜發生苗期病害較重的地方，育苗用的營養土應進行消毒。綠亨一號按1.5克/立方米，對水3000倍均勻噴灑在營養土上，拌勻后裝盆或育苗盤再播種。出苗后要加強管理，移栽前再用綠享一號3000倍液噴淋一次，防治苗期病害效果更好。
5、加強苗床管理
幼苗發病的主要原因是苗床溫度低，濕度大，陰雨天多光照不足。冷床育苗應當播前一次性澆透水，控制苗床澆水，保持床面干燥，采用保溫覆蓋，適時揭蓋，及時通風，控制好苗床的溫濕度，適當增加光照，提高幼苗的抗病能力。只要苗床溫度許可，應及時揭去苗床保溫的不透明覆蓋物，下午適當晚蓋，陰雨天適當揭開透光。