番茄生長過程中，對養分的需求極大，因缺乏某種營養元素導致生理障礙而引起的異常生長現象稱為缺素癥。番茄缺素癥在番茄裁培過程中發生較為普遍，且能經常誘發侵染性病害的發生，因此，及時識別和防治番茄缺素癥是提高番茄產量的重要環節。
常見番茄缺素表現：
番茄缺鈣的癥狀表現：番茄缺鈣時，幼葉發黃，植株瘦弱，萎蔫，頂端生長點壞死。幼果臍部發生腐爛，即臍腐病。一般發生在番茄長至核桃大時。***初表現為臍部出現水浸狀病斑，后逐漸擴大，致使果實頂部凹陷，變褐。病斑通常直徑1-2厘米，嚴重時擴展到小半個果實。
番茄缺鎂的癥狀表現：在番茄花層膨大期，中下部葉從主脈附近開始變黃出現失綠，在果實膨大盛期靠果實近的葉先發生。葉脈間有模糊的黃化現象發生，慢慢地擴展到上部葉，后期除葉脈外整葉都已經黃化，缺鎂嚴重時，葉脈間多呈透明狀。
番茄缺硼的癥狀表現： 葉片變為黃色或桔紅色并出現褪綠斑，植株生長緩慢或停止生長，果實出現木栓化龜裂或銹斑。