煙草施肥料應該選擇哪些品種呢，我們可以根據各項研究再根據種植的實際情況來定奪。
煙草施肥中氮肥形態是一個最有爭議的問題。一些研究表明煙草施用高比例的硝態氮肥優于高比例的錢態氮肥，其依據是硝態氮有利于煙草體內糖類物質的積累，可改善煙草的燃燒性；煙草大量吸收鉸態氮會影響鈣、鎂、鉀等陽離子的吸收，在淋溶作用較強、陽離子代換量較低的土壤上，往往會誘發煙草出現上述元素的缺素癥狀，影響煙葉品質；硝態氮施用后也易被煙株吸收，肥效短，有利于煙草后期快速落黃。
而另一些研究得到相反的結果，并認為，錢態氮肥能促進煙葉中芳香族揮發油的形成，增加煙葉香味；錢態氮肥不易淋溶損失；在缺鉀土壤條件下可促進鉀的釋放。還有結果表明，煙草施用鉸態氮與硝態氮無明顯差異。
但國內多數研究結果認為，二者配合施用的效果優于單獨施用，其中兩者的相對比例因各地氣候條件、土壤類型不同而異，在降雨較多的地區和質地較輕的土壤上，錢態氮肥的比例可占到50%—75％。煙草雖為忌氯作物，但生產上含氯肥料并非絕對禁用，在不同煙區應區別對待。北方煙區，土壤中氯的本底值較高，因此應限制氯化鉀、氯化鉸等含氯肥料的施用；而在南方煙區，由于雨量充沛，土壤中氯的含量較低，有的地區甚至缺氯，可適量分配一些含氯的肥料。煙草能否施用有機肥也是一個有爭議的問題。一些研究認為，煙草有機肥與無機肥配合施用可協調煙株的碳氮代謝，避免單施無機氮時引起的氮代謝過旺，有利于煙草香吃味物質的合成。而另一些研究卻認為煙草施用有機肥對煙葉質量有不利的影響，其依據是：有機肥的肥效釋放不符合煙草的需肥規律，易引起煙葉后期貪青遲熟，影響正常落黃；有機肥的成分復雜，特別是廄肥、堆肥含有較高的氯，影響煙草的品質。但是有機肥來源廣，可緩解化肥供應不足的矛盾，在我國大多數煙區，仍普遍施用。為降低有機肥的不利影響，有機肥在施用前一定要充分腐熟，或提前施用，以利于盡早發揮肥效。此外有機肥在施用前最好在戶外與過磷酸鈣堆積半年到一年，以使大部分的氯流失掉和促進有機肥的腐熟。