近年來，有機肥在果業生產中的增收作用越來越受到廣大果農的關注，投入量不斷加大。如何正確科學地施用呢？這次要明白這次是基肥，必須以有機肥為主，化肥為副。下面來看具體操作流程。
一、不要錯過理想施肥期。8月至10月下旬，秋稍接近停長，在葉片保護良好的情況下，光合同化的有機養分將回流積累。此期施肥，益于花芽分化，深翻時斷根的愈合及新根生長。同時，可改善土壤深層的通氣條件，加快微生物繁殖與增強有機物的分解，從而為下年果樹成花結果、健壯生長打下堅實基礎。如因農活太忙、肥料貴而一等二靠地拖延時間，必將錯過理想施肥時機。
二、秋施基肥，應以樹冠為準，逐年向外擴展，深翻至少40厘米深度。然后將混配好的有機肥分層次施人，把地表的陽土回填到下層，陰土放在上面。不少果農把有機肥當化肥一樣撒地翻施或以淺溝埋人土壤，這樣雖然省力省時，但效果欠佳。有機肥不像化肥一樣下滲于土壤中，施于地表，不能根本解決土壤深層的改良，且易導致根系上浮，降低根部的抗旱抗寒能力。如此，穩重結果的愿望便難以實現。
三、正確認識理解和使用有機肥。有機肥是用各種動植物的有機殘體或遺留物質（有機肥多以植物蛋白為原料）堆漚、腐熟、經有益菌發酵分解為有機質和礦物質類可溶性營養成分的肥料。簡單說，就是將廢殘無用的有機物重新轉化為供植物生長的營養成分。其優點多多，如肥效長、保水保肥、疏松土壤、均衡供養等。而化肥在目前提倡效益和產量的情況下，適量適時施人也很有必要，但它含有的各種酸根離子作用于土壤后，常使土壤板結硬化，造成環境污染。
商品肥中的一部分有機無機復合肥中的氮、磷、鉀含量相對純有機肥的含量較高，因含有有機質和腐殖酸、生物菌類，在作物生長中吸收率要比純化肥效果好。但作為基肥施用時，應以土壤有機質的含量多少來定。若土壤的有機質含量高，地板較好，此肥也可做基肥施入；若土壤的有機質含量低，就不如高蛋白類的純有機肥理想。對于多年板結多腐之地，施用生物類有機肥效果頗佳。