芹菜缺氮不僅使植株生長受阻，葉片細小，而且葉柄易發生空心。前期缺磷，后期缺鉀對芹菜產量和品質影響較大。芹菜對硼肥的反應非常敏感，缺硼時會出現裂莖癥。大棚芹菜應科學澆水、施肥，提高芹菜產量和品質。
苗期小水勤澆。當芹菜芽頂土時，輕澆一次水，1-2天苗可出齊。以后保持土壤濕潤，少量勤澆。澆水量過大，幼苗容易出現徒長或發生爛秧現象。苗高近10厘米時，可隨水追肥1-2次。
定植緩苗后進行蹲苗。定植到緩苗要勤澆、輕澆保持土壤濕潤。緩苗后，植株開始生長，應控制水量并進行中耕，促使根部下扎，心葉分化加速。若水分過大，外葉易徒長，葉心不發達，易發生病害。
營養生長期加大施肥量。蹲苗結束后，植株開始加速生長，應立即追施氮肥，以后分期追施1-2次鉀肥。一般每隔3-4天澆一次水，灌水量可少些，以免地溫過低不利于葉柄肥大。采收前半個月左右全株可噴30-50毫克/千克赤霉素1-2次。