隨著社會的進步人們越來越深刻地認識到長期大量使用化學農藥對生態環境和人類健康的危害。其中拮抗微生物在植病生防中的應用倍受人們關注。在2013年已發現的拮抗微生物中木霉菌（Trichodermaspp.）具有很好的生防活性。
霉菌生物農藥系新型生物殺菌劑。通過產生抗生素、營養競爭、微寄生、細胞壁分解酵素、以及誘導植物產生抗性等機制，對于多種植物病原菌具有拮抗作用，具有保護和治療雙重功效，可有效防治土傳性真菌病害，在苗床使用木霉菌劑，可提高育苗與移植的成活率，保持秧苗健壯生長。也可用于防治灰霉病。
本品特效期長，作用位點多，不產生抗藥性，突破常規殺菌劑受限條件，不怕高濕，而且濕度越大防治效果越好。殺菌譜廣，無殘留毒性，對作物沒有任何不良影響。
木霉菌可抑制多種植物真菌（至目前報道約29種真菌）病，研究最多的真菌是根腐病、立枯病、猝倒病、枯萎病等土傳病害、灰霉菌、腐霉菌、絲核菌、炭疽菌、鐮刀菌、菌核病。木霉菌使用于拌土、拌種、注射及噴灑，經實驗能減少土壤中病原真菌的密度，并降低病害的發生。