適當的使用磷肥能夠提高農作物的產量和品質，有不少農民朋友誤認為磷肥施用越多越好，其實過量施用磷肥不僅無益，而且害處很多。
一是施用磷肥過量，會使作物從土壤中吸收過多的磷素營養。過多的磷素營養會促使作物呼吸作用過于旺盛，消耗的干物質大于積累的干物質，造成繁殖器官提前發育，引起作物過早成熟，籽粒小，產量低。
二是誘發土壤缺鋅。過量施用磷酸鈣后，會使土壤里的鋅與過量的磷作用，產生磷酸鋅沉淀，作物無法吸收，使作物出現明顯缺鋅癥狀；過量施用鈣鎂磷肥等堿性磷肥后，會使土壤堿化，使鋅的有效性降低，影響作物對鋅的吸收。
三是過量施磷會使作物得磷失硅。據研究，過量施用磷肥后，還會造成土壤中的硅被固定，不能吸收，引起作物缺硅，特別是對喜硅的禾本科作物的影響更大。如喜硅作物水稻，若不能從土壤中吸收到較多的硅元素就會發生莖稈纖細，倒伏及抗病能力差等缺硅癥狀。
四是過量施磷會使作物得磷缺鉬。適量施用磷肥，會促成作物對鉬的吸收，但過量施用磷肥，卻會使磷和鉬失去營養平衡，影響作物對鉬的吸收，表現出“缺鉬癥”。