在同一塊的田地中連年種植同樣的蔬菜，會因病菌的存留和蔓延，引起死苗死秧，因此要使用合理的肥料來調節土壤的肥力；會因微量元素缺乏而導致營養不良，造成長勢弱、菜質劣、產量低；會因根系分泌出對自身有害的物質過多導致生長不良。也就是我們常說的連作障礙，連作障礙發生的原因有多種，主要有以下幾方面：
1、病蟲危害加重：病蟲害是連作障礙原因中主要的。這是因為某種病蟲害只寄生在一種或幾種蔬菜上，對它們產生危害，而對其它蔬菜沒有影響，而連作給這些病蟲害提供了賴以生存和繁殖的場所。如瓜類枯萎病、番茄青枯病、根結線蟲病等。
2、營養不足：蔬菜的生育周期較短，復種指數較高，長期栽培某一蔬菜，會對某種元素的肥料吸收較多，如果不能及時補充該元素，容易出現缺素癥狀，造成長勢弱，產量降低等。
3、自毒作用增加：在正常生長條件下作物根系自身分泌有毒物質，同時土壤中的微生物釋放出有害物質，經多年連作，這些有害物質在土壤中的積累越來越多，當土壤有害物質達到某一臨界濃度后，就會引起毒害作用。
4、土壤酸堿度發生變化：長期連作土壤腐殖質降低，團粒結構易遭破壞，土壤中的微生物群體發生改變可能導致土壤酸堿度變化。
為了克服連作給蔬菜生產造成的障礙，在預防技術上，應注意以下幾點：
1、實行輪作換茬：對于病毒源和傳染病已造成嚴重為害的菜地，要對這些病害采取回避措施，定期實行輪作換茬，改變這部分病蟲的生活環境，從而使他們失去寄主，斷絕了它們的營養源，達到減輕或消滅病蟲害的目的。
2、土壤改良：①換土，加一部分養分含量豐富的新土，降低土壤鹽類濃度。②深翻改土，深翻30～60cm改進土壤理化性狀。③灌水洗鹽，在休閑季節進行灌水洗鹽，并及時排除含鹽水分。
3、重施腐熟有機肥：有機肥不僅能增加土壤的有機質及微量元素的含量，還能改善土壤結構，增加保肥、保水、供肥、透氣、調溫等功能。因此在大棚蔬菜的施肥中要增加有機肥的施用量。
4、合理施用氮磷鉀肥料：化學肥料，尤其是氮肥用量過高，會明顯增加土壤中可溶性鹽含量，加重病蟲危害，影響作物的產量和品質。因此，要做到合理施用氮磷鉀肥料，也就是根據各種蔬菜需肥規律及土壤供肥能力來確定氮磷鉀的配比及用肥量。
5、增施微量元素：連作易造成土壤中微量元素的偏耗，因此在施肥時，除應按照作物需肥規律施用氮磷鉀復合肥外，還要注意補充微量元素，試驗證明西瓜、黃瓜、西紅柿使用微量元素肥料，防病、增產效果十分明顯。
6、用良種及嫁接技術：選用抗病、優質、高產的蔬菜品種，是提高抗病能力的前提，也是防治土傳病害為經濟有效的措施。選擇高抗根結線蟲的品種和根部健壯的品種作為嫁接砧木，也是比較有效的措施之一。