在通常情況下，降低氮肥肥效的主要原因是土壤性質：首先考慮土壤本身的供氮水平，因地制宜地施用氮肥。根據土壤肥力的狀況確定施肥量，肥力高的地塊少施，肥力低的地塊多施。氮肥分配到中、低肥力田塊的比例大于高肥力田塊。因為中低肥力田塊的增產潛力大于高肥力田塊，根據多年多點肥料試驗結果表明，中、低田塊每公斤氮增產稻谷4千克，小麥5千克，玉米5.5千克，比高產地增產潛力大。
土壤對不同類型的氮肥也有很強的選擇性，酸性土壤可選擇堿性肥料和生理堿性肥料及中性肥料，如氨水、碳酸氫銨、尿素、硝酸鈣等。在沙質土壤上施用氮肥應少量多次，基肥少施，增加追肥次數，并且不適于施用硝態氮肥。
其次是作物的營養特性：作物對于氮肥也具有選擇性，不同作物種類對于氮肥的形態和品種的選擇不一樣。水稻、小麥、高粱、玉米等禾谷類作物，以及棉花、蔬菜、果樹是需氮較多的作物，氮肥的施用量應大些。大豆、花生等豆類作物有根瘤菌共生固氮，對氮要求不迫切，可以少施或不施氮肥。
同一作物不同品種的需肥能力不同，水稻中的雜交稻、粳稻等，由于根系發達，吸收和需求氮量比常規稻多。