辣椒種植前后由于方法的不當、經驗的缺乏很容易造成病害，影響作物的成長，造成產量的下降，以下三種防治方法值得借鑒。
（1）農業防治：①選用優質、高產、抗病品種。②避免與花生、茄科類作物連作。可與十字花科等作物輪作，是水旱輪作。③前茬收獲后及時清理殘枝落葉，集中燒毀或深埋，耕翻土地，以減少病原基數。菜椒生長期和收獲后及時田間病株和病殘體，嚴禁將病株和病殘體隨意堆放，應集中燒毀。并在田間噴施護樹將軍。
（2）物理防治：育苗前，將種子用55℃溫水浸泡30分鐘。
（3）藥劑防治：①發病初期用50%氟嗎錳鋅(施德益)900克/公頃，或68%精甲霜·錳鋅(金雷)水分散粒劑1500～1800克/公頃+新高脂膜對水噴霧。每隔7～10天噴～次。