棉花苗期肥害應該提早防御，怎樣正確的使用肥料進行防御，有3點方法值得借鑒：
一是搞清棉花的需肥規律棉花是需肥量比較大的作物之一，但苗、蕾期需肥只占全程需肥的20%~30%，大量需肥在開花至結鈴盛期，因此，比較適用的施肥經驗應該是：底肥足，苗肥速，蕾肥穩，花鈴肥狠，普施桃肥。氮、磷、鉀的施肥比例應為1∶0.3∶1。
二是配方施足底肥一是有條件的地方，要以有機肥為主，配施適量的磷鉀肥料，農家積造的有機肥每畝施4000公斤左右，配施磷肥25公斤，鉀肥15公斤。二是施用無機肥的，應以復合肥為主，高含量的每畝施25公斤，中含量的每畝施50公斤左右，并配施鉀肥10公斤，持力硼0.4公斤，鋅肥0.5公斤。三是采用打洞移栽缽苗的，施肥后要用細土隔離，然后再栽缽苗。
三是快速施用苗肥底肥較足的棉田，施用一次苗肥即可，底肥不足的棉田，苗期應施兩次追肥，次每畝施用尿素5公斤，第二次每畝施用尿素8~10公斤，亦可施用碳酸氫銨25公斤左右，或施清水糞提苗。苗期要突出以肥提苗。