木瓜屬于薔薇科木瓜屬植物，其木瓜營養豐富，木瓜本身耐瘠薄，耐鹽堿，不畏懼耐澇。木瓜施肥多數在秋季，基肥施用量占全年總施量的70%左右。
追肥應選擇在萌芽前，每株穴施或溝施尿素130克，三元復合肥400克。花前花后2周各噴1次0.3%尿素、1%過磷酸鈣、0.3%硫酸鉀的混合液，以促進果實細胞分裂；盛花期噴0.2%的硼酸或0.3%硼砂，利于坐果。5月中下旬對結果樹每株追施尿素100-250克，施入條溝即可。果實采收后，追施以氮肥為主的復合肥，每株0.5千克。
木瓜盛果期樹應及時追施花前肥、花后肥、果實膨大肥，花前株施果樹專用肥0.2—0.3千克，平時，結合防治病蟲噴施0.2%尿素和0.2%磷酸二氫鉀，果實膨大期以施磷鉀肥為主。秋施基肥，結果樹每株施有機肥10—15千克，并拌入0.5—1.0千克三元復合肥，幼樹施肥量酌減。施肥后灌一遍透水，注意花期控水。干旱地區栽植后樹盤內應覆蓋地膜或覆草保墑。
木瓜也應供給水分的管理，一般在發芽前后，灌一次透水，果實膨大期和新梢生長期，應適當灌水，木瓜在入冬前，施基肥灌1次防凍水，同時，木瓜怕澇，應適時排水。