辣椒霜霉病主要傷害葉片、葉柄及嫩莖。葉片染病時，剛開始出現淺綠色不規則形病斑，葉背面有稀疏的白色霜霉層，病葉變脆并向上卷，后期葉片易脫落。葉柄、嫩莖染病，呈褐色水漬狀，病部也出現白色稀疏的霉層。
防治方法主要有：
，選用抗耐病品種，實施2年以上輪作。收獲后田間病殘體，集中深埋或燒毀，并及時深翻。
第二，通過調控棚室內溫濕度，縮短結露持續時間可控制辣椒霜霉病發生。十一月到第二年的二月保護地溫度10度到25度，濕度在75％到90％時容易發生辣椒霜霉病，一般采用通風散濕提高棚室溫度防止發病，當晴天上午溫度升到28度到30度時，進行放風，溫度控制在22度到25度，可降低濕度，當溫度降至20度時，要馬上關閉通風口，保持夜溫不低于15℃，可以大大減少結露量和結露持續時間，就可減輕辣椒霜霉病發病率。
第三，田間發病后及時進行防治，在發病初期田間出現發病中心時，可采用以下劑或配方進行防治：50％錳鋅·氟嗎啉可濕性粉劑2000倍液；68％精甲霜·錳鋅水分散粒劑800到1000倍液；60％唑醚·代森聯水分散粒劑2000倍液；25％吡唑醚菌酯乳油3000到4000倍液＋70％代森聯干懸浮劑500倍液；53％甲霜·錳鋅水分散粒劑600到800倍液；20％苯霜靈乳油300倍液＋75％百菌清可濕性粉劑600到1000倍液；72％霜脲·錳鋅可濕性粉劑800倍液；72.2％霜霉威水劑800倍液＋70％代森錳鋅可濕性粉劑600到1000倍液；25.75％多抗·福美雙可濕性粉劑1000到1500倍液；60％琥·鋁·甲霜靈可濕性粉劑600到800倍液；75％百·福·福鋅可濕性粉劑800到1000倍液；對水噴霧，視病情隔5到7天噴1次；發病普遍時，可采用下列劑或配方進行防治：50％烯酸嗎啉可濕性粉劑2000倍液＋70％代森聯干懸浮劑500倍液；687.5g/L氟菌·霜霉威懸浮劑1000倍液＋70％代森錳鋅可濕性粉劑600倍液；25％甲霜·霜霉威可濕性粉劑700倍液＋75％百菌清可濕性粉劑500倍液；100g/L氰霜唑懸浮劑1000倍液＋50％克菌丹可濕性粉劑800倍液；72％霜脲·錳鋅可濕性粉劑500倍液；70％丙森鋅可濕性粉劑500倍液；60％唑醚·代森聯水分散粒劑1000到2000倍液；84.51％霜霉威·乙麟酸鹽可溶性水劑600到1000倍液；70％呋酰·錳鋅可濕性粉劑600到1000倍液；雨季，在下雨前進行莖葉噴霧防治（重點噴果），根據病情隔7到10天噴1次。
第四，保護地栽培時還可以使用45％百菌清煙霧劑250g/畝或20％百·福煙劑250到300g/畝或20％錳鋅·霜脲煙劑250到300g/畝。傍晚封閉棚室，將藥分放于5到7個燃放點，煙熏過夜或噴撒5％百菌清粉劑lkg/畝。間隔7到10天用1次藥，與噴霧防治交替進行。