劑要想起到的作用，要根據不同的病菌選擇不同的劑，還要注意各種不同類型的劑要交替使用，防止病原菌產生抗藥性。使用劑要特別注意，以免藥性過高，對作物生長造成不好的影響。
為預防蔬菜根部病害，菜農常用農藥劑灌根防治蔬菜根部病害。這種方式雖然效果好，但在灌根時的一些注意事項也不能忽視，否則，不僅收不到應有的效果，還會有副作用。
對于已使用菌肥的棚地，預防蔬菜根部病害盡量不要用農藥劑灌根，以免將菌肥中的生物菌殺死，使菌肥失去應有的效果。但如果蔬菜已經發生根部病害，則必須用農藥劑，像惡霉靈、多菌靈等進行灌根，可以不考慮菌肥中的生物菌，以免因小失大。
使用劑灌根前不宜進行澆水。一方面是因為作物的根部病害已經發生，若澆水，病菌會隨流水進行傳播，造成更多死棵。另一方面是因為澆水容易導致土壤透氣性下降，根部缺氧，產生漚根，抗逆性降低，使病原菌更容易浸染。另外，澆水后再進行灌根，藥液更難下滲，用藥過多還容易使土壤透氣性更差，易造成作物漚根，加劇死棵發生，所以在灌根前不宜進行澆水。使用農藥劑灌根后如果立即澆水，土壤中的藥液濃度會被稀釋，影響防病效果。特別是在大棚內灰霉病，霜霉病等頑固性病害，用嘧霉胺，霜霉威等藥液進行灌根時，一定要注意施藥量和溫度的把控，因此，在使用劑灌根后的幾天內要盡量不要澆水，并保持棚內的通風換氣等。蔬菜需要澆水時，可在定植溝內溜小水，以水面到壟高的三分之一處為宜。
使用農藥劑灌根后，一旦出現萎蔫、黃化、滯長等藥害癥狀應及時補救，以免造成損失。補救措施一是迅速澆水一次，以稀釋土壤中藥液的濃度；二是及時用生根壯苗劑或云大120，噴淋同時灌根，這樣就可以緩解藥害，恢復植株的長勢。