棉花合理施肥就是依據棉花養分吸收特點，結合土壤肥力狀況和環境條件，以及棉花長相長勢，合理把握肥料用量，達到優質、高產、的目的。合理施肥要供應棉花對養分的需求，保持和提高土壤肥力，提高肥料的效益，但又不造成肥料浪費，防止環境污染。
近年來隨著農業科技知識的傳播，農民在棉花種植上逐步走向科學化，不管是在施肥、化控還是病蟲害防治上都有不斷改善。但是，據調查，棉農不重視鋅肥的施用，只有很少一部分棉農使用鋅肥，其實鋅肥對棉花的生長起到很重要的作用。
棉花缺鋅時，會使植株矮小，葉小而簇生，葉面兩側出現斑點，脈間失綠，葉片增厚、發脆、邊緣向上卷曲，節間縮短，生育期推遲。棉花葉片含鋅量低于每公斤十五毫克或土壤有效鋅低于每公斤零點五毫克，都會出現缺鋅現象，而大多數堿性土壤都容易缺鋅。
棉花是對鋅比較敏感的作物。鋅能促進棉花對養分的吸收，協調養分運轉，增強光合作用，延長功能葉壽命，減少蕾、鈴脫落，增加鈴重和衣分，提高產量和品質。科學實驗表明：不施用鋅肥，每株14.7個鈴，脫落率為45.4%，霜前花為65.3%，百鈴重為385克，衣分為35.07%，絨長為30.15毫米。施鋅肥的為每株15.2個鈴，脫落率44.5%，霜前花70.4%，百鈴重409克，衣分35.14%，絨長30.7毫米。鋅還可以提高棉花的抗逆性，如果在四十度到四十五度下，施鋅的比不施鋅的葉片組織壞死率降低1.6%到2.2%，在五十五度到六十度的高溫下，葉片組織壞死率降低9.5%到10.6%，還可以增強棉花抗黃、枯萎病的能力。
鋅肥的施用一般在施基肥時加進去就可以了，通常在棉花播種或定植前結合耕翻整地畝施硫酸鋅一到一點五公斤做基肥，還可以在棉花開花結鈴期進行噴施，每次每畝噴施0.2%的硫酸鋅溶液60到70公斤，連噴2到3次。