菠菜霜霉病主要傷害葉片，病斑從植株下部向上擴展，病斑剛開始的時候呈淡黃色，擴大后呈不規則形，邊緣不明顯，葉背病斑上產生灰白色霉層，后變灰紫色，發生嚴重時，病斑互相連結成片，后期變黃褐色枯斑。如果遇到濕度較大的雨天，菠菜將會變褐，腐爛，甚至整株葉片都會變黃枯死。
菠菜霜霉病發病的適生育時期是菠菜5片葉以上時，發病高峰期為春季三四月和秋季九到十二月之間，一般春季雨水較少較小發病輕，秋季雨水多且雨水重發病就重。常年連作地塊，與其他常發霜霉病蔬菜鄰作或連作，當地勢低洼、易積水、播種密度過大田間郁閉、通透性差時發病較重。
菠菜霜霉病的防治方法可以從四個方面著手。一是與茄果類等非綠葉菜類蔬菜輪作2到3年；二是施足腐熟的有機肥，適時播種，合理密植；三是適量澆水，雨后及時排水，降低田間濕度，鏟除田間和地邊雜草，收獲后及時田間病殘體；化學防治主要兩個階段，在發病初期可采用下列劑或配方進行防治：560g/L嘧菌·百菌清懸浮劑2000到3000倍液；52.5％惡酮·霜脲氰水分散粒劑1500到2000倍液；76％霜·代·乙膦鋁可濕性粉劑800到1000倍液；70％丙森鋅可濕性粉劑600到800倍液；72％甲霜·百菌清可濕性粉劑600到800倍液；對水噴霧，視病情隔7到10天噴1次；田間較多株發病時，應加強防治可采用下列劑或配方進行防治：687.5g/L霜霉威鹽酸鹽·氟吡菌胺懸浮劑800到1200倍液；250g/L吡唑醚菌酯乳油1500到3000倍液；66.8％丙森·異丙菌胺可濕性粉劑600到800倍液；84.51％霜霉威·乙膦酸鹽可溶性水劑600到1000倍液；50％烯酰嗎啉可濕性粉劑1000到1500倍液加上75％百菌清可濕性粉劑600到800倍液；440g/L雙炔·百菌清懸浮劑600到1000倍液；68％精甲霜·錳鋅水分散粒劑800到1000倍液；25％烯肟菌酯乳油2000到3000倍液加上75％百菌清可濕性粉劑600到800倍液；對水噴霧，視病情隔5到7天噴1次。農藥要交替施用，防止產生抗藥性。