在大棚溫室栽培番茄的時候，往往會出現作物莖干上有不定根的現象，某些在莖基部，某些在莖干中部。
番茄的莖上出現不定根，主要因素是因為作物的根系吸收水分不充足，或者是作物的根系部位的呼吸受到抑制，或者是作物根系吸收而來的水分不可以朝植株面運輸致使的。我們可以將其分為生理原因以及病理原因。
、生理原因
在土壤含有過高的水量，土壤的通氣性比較差，作物的根系活動變慢，但是它的吸水量就會減弱，出現這種情況將會使番茄上長出不定根，而得到更多的水，并且補給不充足的氧氣。還有，若是空氣的濕度比較高，為得到大量的氧氣，導致植株產生更多不定根。
第二、病理原因
因為某些侵染性的病害損害植株輸導組織，導致土壤上面的植株嚴重缺乏水分以及養分供給，導致植株產生不定根。
通常致使作物莖產生不定根的病害都有性潰瘍病、莖基腐病等多種。若是發現莖上出現不定根之后，我們首先需要去分辨是不是性潰瘍病而造成的，該種病害造成的不定根一般是非常密集。
對于性潰瘍病的主要病癥：整個植株或者是某一分支葉片慢慢的出現枯死；葉片從葉緣開始逐漸產生病癥，并且不斷的朝葉片的內部擴展，這些病斑呈現不規則形狀，在邊界大多是弧形形狀，出現黃暈，無霉層；果實表層出現木栓化的鳥眼斑。
第三、技巧
對于那些因為生理原因而造成莖部產生不定根情況，首先應該注意使空氣的濕度降低下來，降低給土壤澆水的量，若是無鋪蓋地膜者可以進行中耕松土，增強土壤通氣性能。由于生理性原因而造成的不定根它是對植株是沒有害處的的，只是說明管理水平不好。而病理性因素造成的不定根，那么我們就需要認真的辨別，并且噴灑、澆灌恰當的藥劑，防治這中病害非常困難，所以我們需要預防為主。