在農田應用上，這類肥料的施用途徑與大化肥不盡相同，一般都是與灌水相結合，通過不同灌溉方式將肥料和灌溉水一體化施到根圍土壤或作物葉面。根據灌水方式的不同，施肥又可分為沖施肥、噴施肥、滴灌肥等。固態水溶肥的施用，先溶解并配成混合溶液，再進行灌施或噴施。液體水溶肥需裝備有管道、貯罐、施肥機等配套設備，肥料很易溶入灌溉水中，既可噴灌和滴灌，也可兌水稀釋后直接作葉面肥噴施。
水溶肥的優點：其一，采用水、肥同施，以水帶肥，實現了水肥一體化，施肥效率高，并可以減少施肥總量，發揮肥水協同效應，使肥和水的利用效率都明顯提高。其二，肥效快，可解決高產作物快速生長期的營養需求。
水溶肥的缺點：其一，水溶肥料價格普遍較高，不利于普及。其二，性強，難以在土壤中長期保存。用肥量要嚴格控制，如果單次使用稍多，就會造成肥料流失，既降低施肥的經濟效益，達不到高產優質的目的，還會造成水環境的污染，不利于可持續發展。