薏苡的田間管理措施中，除草是一項不可少的步驟，除草間苗時進行一次中耕除草，定苗時再進行一次，以后視土壤板結和雜草孳生情況結合追肥進行。在生長期用苯甲酸類除草劑如麥草畏（百草敵）進行莖葉處理，可防除一年生或多年生闊葉雜草。
追肥在生長過程中一般追肥2-3次。次追肥在苗高4-7厘米時進行，每畝追施硫酸銨5-10公斤，或腐熟人畜糞尿1000公斤，促進幼苗生長，早分蘗、多分蘗；第二次追肥一般在拔節初期，主莖11-12葉期進行，每畝追施硫酸銨10-15公斤或腐熟的人畜糞水1500公斤，促使植株生長健壯，有利于孕穗；第三次追肥，應視苗情地力追施攻穗肥，每畝施尿素3-5公斤或用0.3%磷酸二氫鉀肥液作葉面噴施，促進籽粒飽滿，提高品質和產量。
摘腳葉在薏苡拔節后，將分枝以下的老葉和無效分蘗摘去，有利通風透光，促進莖稈粗壯，對防止倒伏也有一定的效果。
人工輔助授粉薏苡仁花單性，雖異穗同株，靠風力傳播授粉，但在揚花期無風或風力不大時，雌花就不能完全授粉，會形成空癟粒。可在盛花期，采用人工振搖莖稈，使花粉飛揚的方法來提高結實率，增加產量。