近年來，農產品的質量出現了很多人們意想不到的問題；而加入WTO則意味著農產品質量如過不了關，不僅外向型農業無從談起，國內市場難以占領，現有的市場也將逐步失去，農業將面臨嚴峻形勢而累及國民經濟的健康運行。如何確保農產品質量正日益成為全社會關注的焦點問題之一。
開展農產品市場質量準入制度，被認為是農產品生產和消費的有效措施。這既是發達國家的通行做法，也是國內農產品質量管理的必然趨勢。嚴格的市場準入，不僅可以有效阻止有毒有害農產品走上城鄉居民餐桌，而且可以促進優質和無公害農產品的生產，促進農民增收。
近年來，農業部開始積極推行農產品市場準入管理，2002年初即決定緊緊圍繞農產品質量加強批發市場環節的質量檢測，開設無公害農產品專銷區，以把好市場準入關口，逐步建立市場自檢制度。
各地也把農產品市場準入管理工作提上重要日程。北京市和江蘇省分別從2002年7月1日和8月1日開始在所轄范圍內實行農產品市場準入制度。