蔥遇到病害真是一件讓人很難受的一件事，蔥的主要病害是紫斑病、蔥銹病、軟腐病等：主要的蟲害是蔥薊馬、潛蠅、夜蛾等。
1、紫斑病主要為害葉和花梗。初呈水漬狀白色小點，后變淡褐色圓形或紡錘形稍凹陷斑，繼續擴大呈褐色或暗紫色。發病適溫25— 27℃，溫暖多濕的夏季發病重，老苗、缺肥田塊發病重。防治：輪作：發病初期用百菌清500倍或殺毒礬500倍或撲海因1500倍噴霧。7—10天1次，連續3—4次。
2、蔥銹病主要為害葉、莖、花梗。初呈橙黃色或黑褐色瘡斑，后散出橙黃色或暗褐色粉末。病孢子萌發適溫9— 18℃ ，高于 24℃ 萌發率明顯下降，氣溫低的年份、肥料不足及生長不良發病重。防治：施足有機肥，增施磷鉀肥：發病初期用敵力脫3000倍或代森錳鋅1000倍或百菌清500倍液噴霧。10天1次，連續2—3次。
3、大蔥軟腐病由引起，高溫高濕、機械傷、蟲口傷容易引起病害流行。病害癥狀為大蔥地上部分倒伏，容易拔起，莖下部腐爛，并有惡臭。防治：保持田間排水暢通，雨后不積水：及時防治害蟲以防傳病，培土時避免損傷大蔥。藥劑可采用77%豐護安(或77%可殺得)500倍液、72%農用硫酸鏈霉素4000倍液防治。 4、霜霉病：霜霉病一般發生在春、秋兩季，危害葉片及花梗，花梗上初生黃白色或乳黃色較大侵染斑，病斑卵形或橢圓形，病株矮化，葉片扭曲畸形，呈蒼白綠色，潮濕時病斑上生白色絨霉，干燥時病斑變為枯斑，病部上方葉片下垂干枯，后期變為淡黃色或暗紫色。防治：用50%甲霜銅可濕性粉劑800倍液，75%百菌清可濕性粉劑600倍液，噴施到全株上7-15天噴一次連噴三次。
5、蔥薊馬：成蟲體長1.2—1.4毫米，為害蔥的心葉、嫩芽。在25℃和相對濕度60%以下時，有利蔥薊馬發生.防治：可用克露、萬靈3000-4000倍液、康福多4000倍或蚜虱凈2000倍或艾美樂20000倍，每隔5-7天噴霧一次，連噴2-4次。
6、潛蠅：以幼蟲在葉肉組織內蛀食，啃食葉肉，造成減產和品質下降，同時又傳播病害。防治：潛克2500倍或速凱1500倍或殺蟲素3000倍或殺滅菊酯2000倍液噴霧。用藥時間以上為宜。
7、夜蛾：斜紋夜蛾和甜菜夜蛾也為害大蔥，啃食葉片并鉆蛀入大蔥。防治：可用52%的農地樂乳油1000-1500倍液，或5%的氯氰菊酯乳油1500～2000倍液、卡死克1500倍或米滿1500倍液、安打3500倍液噴霧防治。防治夜蛾的噴藥時間，在傍晚或黃昏時防效好大蔥葉面有蠟粉，為了提高藥劑附著力，藥液中要加入中性皂。采收前10天停止用藥。僅供參考。