溫室也不是一件容易的事，在溫室黃瓜栽培過程中經常會發現黃瓜莖蔓或嫁接口處腐爛、流膠的現象。造成此現象的主要原因是由于病菌侵染，侵染黃瓜地上部莖蔓及嫁接口的病害主要有疫病、蔓枯病、枯萎病、菌核病等。其主要被害癥狀有兩種：
一是水浸狀。
莖蔓軟化縊縮，嚴重者表皮完好，但內部腐爛，維管束不變色，多發生于嫁接口以上。主要病因為疫病，可用施得益、霉克特加新高脂膜葉面噴施。
二是在接口或摘瓜后的傷口流出琥珀色或白色膠狀物。
這種情況主要是蔓枯病和枯萎病侵染所致。這兩種病害可采用灌根、涂抹、噴霧三種方法交替防治。灌根可用枯萎田丹+巴巴安或黃萎絕+生根液；噴霧可用壯瓜蒂靈使瓜蒂增粗，強化營養定向輸送量，需每隔5~6天噴1次；涂抹可用坐瓜靈+真素或坐瓜靈+田丹。