引起辣椒發生根病的原因差別很大，認真區分癥狀，準確定性是及時有效防治的關鍵所在，現將辣椒根病主要癥狀及其藥劑防治介紹如下：
1、疫病、性病害。莖基部出現墨褐色病斑是其主要特征，在莖木質化前染病，病部明顯縊縮，造成上部折倒，木質化后病斑繞莖一周后植株凋萎，急速干枯而死。是辣椒生產中常見、極具危害、毀滅性的病害。藥劑防治：及時噴灑或灌根甲霜銅800倍液，64%殺毒礬400-500倍液，或辣椒疫病靈粉劑培根，棚室內初期可用百菌清煙霧劑、粉尖劑防治。
2、根腐病、性病害。辣椒定植后，起初病株枝葉白天萎蔫，傍晚至次日早晨恢復，反復多天后整株枯死，病株根莖部及根部皮層呈褐色腐爛，極易剝離，露出暗色木質部。藥劑防治：及時噴灑或灌根50%多菌靈600倍液，40%多硫懸浮劑600倍液或50%甲基硫菌靈可濕性粉劑500倍液。
3、枯萎病、性病害。發病初期，植株下部葉片大量脫落，與地面接觸的莖基部皮層呈水浸狀腐爛，地上莖葉迅速凋萎，剖檢病株地下部根系也呈水浸狀軟腐，皮層極易剝離，木質部變成暗褐色至煤煙色，濕度大時，病部產生白色或藍綠色的霉狀物。藥劑防治：初期噴灑50%多菌靈600倍液、40%多硫懸浮劑600倍液。12%綠乳銅乳油600倍液可噴灑亦可灌根。此外，也可用50%DT可濕性粉劑400倍液或14%絡氨銅水劑300倍液灌根。
4、青枯病、性病害。發病初期葉片白天萎蔫，夜間恢復正常，反復3-5天，葉片變褐枯焦而死，莖部外表癥狀不明顯。縱剖可見維管束變為褐色，橫切面保濕后可見乳白色黏液溢出，別于枯萎病。藥劑防治：進入發病階段噴14%絡氨銅水劑300倍液，77%可殺得可濕性微粒劑500倍液、硫酸鏈霉素或72%農用鏈霉素4000倍液，7-10天1次，連續3-4次，也可用50%敵枯雙全可濕性粉劑800倍液、50%DT可濕性粉劑400倍液灌根。
5、漚根。主要是由于土壤溫度過低，積水和水溫過低引起的生理病害，定植后不長新根，幼根表面開始呈銹褐色，后逐漸腐爛，地上部葉片變黃，嚴重時萎蔫而死，幼苗易被拔起。防治方法：提高地溫、大棚栽培要在定植前7-10天鋪地膜、扣棚，促使定植后新根生長。注意水溫，定植后澆水應在晴天上午11：00前或下午4：00后進行，水溫過低，特別是中午灌溉水溫過低，易引起辣椒萎蔫死亡。防止積水，辣椒喜土壤潮濕，但是不耐澇，短時的積水常可造成根系窒息死亡。因此澆水時切忌澆大水，澆水之后能很快滲下去，壟行間不積水，及時中耕松土。僅供參考。