硼元素對西瓜植體內碳水化合物的形成和運轉起著重要作用，并能促進分生組織的迅速生長和生殖器官的正常發育，還能防止多種生理性病害，如缺鈣癥、葉灼癥等。
癥狀：西瓜缺硼時，從伸蔓期開始，藤蔓叢生，生長點受到抑制，發白，葉片小，葉面皺縮，凸凹不平，往往會誤診為病毒病。缺硼植株的新蔓上有橫向裂紋，脆而易斷，有時有褐色黏稠狀物流出，而西瓜病毒病無此現象；西瓜缺硼病沒有發病中心，而西瓜病毒病有發病中心，并向四周蔓延。花少或不開花，花期發育不良或畸形，難坐瓜，坐瓜后，導致畸形瓜多或形成空心瓜。
病因：酸性或砂質土壤比較容易缺硼。土壤干旱，造成土壤中可溶態的硼含量少，滿足不了植株迅速生長的需要，也可引起缺硼。
防治方法：施足基肥。底肥中每畝加入持力硼200~400克或11%硼砂1公斤。硼砂可混入有機肥料中施用，但不能和過磷酸鈣混施，也不宜和尿素混施，以防硼元素被固定或鈍化。在4~5節位開始噴施硼砂50~100克，或用微補花力800倍液加微補硼力2000倍液，連續噴2次。癥狀發生后，用微補硼力3000倍或速樂硼2000倍滴灌，同時西瓜移栽后每隔5~7天噴施微補花力800倍液加微補硼力2000倍液，連續噴3~4次即可。