專家的多次研究表明：在自已的農田如果施用很多化肥的話，它的營養成分不能快速地吸收利用，氮、磷、鉀等一些化學物質易被土壤固結，形成各種化學鹽分，在土壤中積累，造成土壤養分結構失調，物理性狀變差，部分地塊有害金屬和有害病菌超標，導致土壤性狀惡化。
導致產品品質下降
偏施某種化肥，導致作物營養失調，體內部分物質轉化合成受阻，造成產品品質降低，如現在的瓜果吃起來不甜，蔬菜吃起來不香，并且容易腐爛，不能存放，其原因都是超標施化肥。
導致環境污染
由于施入過多的化肥，土壤水溶性養分等物質被雨水和農田灌水淋溶到地下水及河流中，造成部分地區的地下水及河流污染，使地下水、河流、湖泊呈富營養化，導致地下水不好喝，部分河流、湖泊內的魚蝦常發生死亡的現象。
導致產收比大
一是受耕作栽培水平、作物需肥量等因素所限，作物不能獲得很高的產量；二是由于過多地施用單一性的幾種肥料，造成營養不平衡，養分失調，只增加成本不增加產量，并造成了低品質的農產品不易銷售或價格偏低等，給農民帶來了損失。