南瓜果腐病，又叫花腐病，發病時滿身長黑毛，一般是上面剛坐住的那個。病斑首先是從萎蔫的花朵處開始出現，而后從瓜蒂浸入并逐漸蔓延到幼果上，被害的果實從頂部向下腐爛，在病斑上長出濃密的黑色大頭針狀病菌孢子，使果實迅速腐爛。其病原菌是瓜笄霉，是接合菌亞門的一類真菌，適樂時對真菌中的子囊菌、半知菌、擔子菌亞門的病原菌有較好的防效，因此點花藥中加的適樂時對南瓜果腐病的防效有限，不能夠阻止其發病。
小南瓜果腐病防治方法：開花至幼果期噴灑78%波·錳鋅（科博）600倍液或86.2%氧化亞銅（銅大師）1000倍液。發病初期噴灑72%錳鋅·霜脲（克露）600倍液或69%錳鋅·烯酰（安克錳鋅）700倍液、60%氟嗎·錳鋅（滅克）700-800倍液。當前隨著溫度的下降要特別注意控制棚室濕度，避免出現低溫高濕的情況，陰天如需用藥，提倡用百菌清煙劑，每畝250g。
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