導致番茄莖稈氣生根多發的原因有很多。我們來一一了解一下。
首先是細菌性髓部壞死。從近幾年能夠誘發番茄大量產生氣生根的病害來看，細菌性髓部壞死要數首位。這種病害前期侵染時非常隱蔽，從疏葉、摘果所產生的傷口侵入，繼而導致莖稈內的髓部腐爛，隨著病害的發展，繼而影響到木質部和韌皮部，從而影響了水分和有機養分的運輸。判斷的關鍵點是中上部葉片萎蔫、莖稈出現大量氣生根或突出，剖開莖稈后可見髓部變褐腐爛。
其次是根部病害。主要以莖基腐病和根腐病為主，當這兩種病害致使養分運輸受阻時，也會在莖稈上表現出氣生根。但由于這兩種病害主要是抑制了水分的運輸，因而一般還未誘發氣生根時植株便萎蔫死亡。在濕度大時，這兩種病害的前期侵染可能會誘導氣生根的出現。
再就是萘乙酸等為害。萘乙酸有促進生根、；ū９淖饔。在生產中，很多菜農會在辣椒出現落花落果時噴萘乙酸以達到保花保果的效果。而在番茄上，若萘乙酸使用過量就會誘導氣生根的大量發生，同時伴隨著莖稈扭曲的情況。有的肥料中添加了適量的萘乙酸，會有良好的生根效果，但使用過量時也會出現上述情況。
當然，若是棚室中有適宜的溫度和持續的高濕度，番茄莖稈上也會出現大量的氣生根，當溫度不適或降低濕度以后，氣生根便不再生長或干燥脫落。