主要危害
大蔥病毒病又稱黃矮病，發病高峰期在9月中旬至10月中旬。主要危害葉片，在苗期和成株均可發病。
病原菌為黃矮病毒。主要潛藏在病株或鱗莖內越冬，依靠蚜蟲、薊馬傳播。早春早播病害較輕，晚播則病害較重，尤其是低洼地，氮肥過多時病害嚴重。
當葉片染上病害，會影響新葉的生長，變得嫩薄，葉色變淺，心葉上出現淡黃色斑，葉面皺褶扭曲，凹凸不平，蔥管扭曲，蠟質減少，葉下垂變黃。接下來生長速度變緩或停止生長。且植株矮小，葉尖現黃綠色斑駁，逐漸黃化，或長短不一黃斑，嚴重的全株矮化或萎縮，整株枯死，嚴重影響品質和產量。發病后輕者減產20%—30%，嚴重的能減產75%。
防法技術
目前來說，防治方法主要有農業防治法和農藥防治法。
農業防治法，主要有選擇抗病性強的品種，剔除有病、蟲和帶毒蔥種；避免連作，與韭、大蒜等蔥屬作物鄰作或者連作，減少田間自然傳播；加強田間管理，使植株生長健壯；掛銀灰膜條避蚜；一旦發現病株，要及時拔除，減少病原；種蔥用80%敵敵畏乳油1000倍液浸泡24小時殺螨。
農藥防治法，發病初期噴10%混合脂肪酸水乳劑1000倍液，或1.5%烷醇硫酸銅乳油1000倍液，或0.5%菇類蛋白多糖水劑250—300倍液，毎隔10天噴1次，共2—3次。為避免產生抗藥性，各種農藥輪換使用。也可以用0.5%菇類蛋白多糖水劑250倍液灌根，毎株50—100亳升，毎隔10—15天1次，連灌2—3次，可噴淋與灌根相結合進行防治。