對花草樹木而言，不是所有的除草劑都能用，也不是所有的都管用。有些除草劑如若用法不當，很可能造成一些不必要的浪費，現總結不宜在園林、花卉苗圃和草坪中使用的除草劑如下：
防除闊葉雜草的苗后除草劑 2甲4氯、2，4-D、苯達松、百草敵、使它隆、虎威、克莠靈、好事達等，不可在苗圃、園林、馬蹄金草坪應用。
防除禾本科雜草的苗后除草劑 蓋草能、精穩殺得、精禾草克、拿捕凈、收樂通、噴特等防除禾本科雜草的苗后除草劑，不宜在禾本科植物草坪使用，這類除草劑在防除禾本科雜草的同時，亦會傷害草坪。
持效期長的除草劑 磺酰脲類除草劑如綠磺隆、甲磺隆、芐磺隆、吡嘧磺隆、豆磺隆、胺苯磺隆、煙磺隆等；脒唑啉酮類除草劑如普殺特等；雜環類除草劑如快殺稗、廣滅靈等。這些除草劑在土壤中的持效期太長。在使用過這些除草劑的苗圃，3年以后種植的花卉苗木都可能受到傷害，3年后播種草子也可能受到傷害。甲磺隆會造成高羊茅草子不發芽，若對高羊茅草坪噴霧，會造成高羊茅發黃、死亡。廣滅靈會造成草坪植物白化。
對土壤有毒化作用的除草劑 酰胺類、脲類、均三氮苯類的一些除草劑及甲草胺、乙草胺、伏草隆、賽克津、西瑪津、阿特拉津、撲草凈、棉草伏等。若在草坪應用這些除草劑后，在積水的情況下對草坪植物的根系有影響，進而影響草坪植物的發育；在連續應用的地方，會造成土壤結構惡化、板結，影響草坪植物根部周圍土壤的通氣性，繼而造成草坪植物發黃。
毒性高或致癌的除草劑 五氯酚鈉和百草枯毒性很高，在苗圃和草坪禁用。除草醚因致癌已在許多國家禁用，我國從2000年開始已經禁用。拉索對動物有致癌作用，亦不宜使用。氟樂靈因致癌在歐洲已被禁用。
有飄移污染的除草劑 百草敵、禾大壯等的飄移污染問題較大。一般在草坪周圍都有花卉苗木，在草坪上噴施百草敵、禾大壯等易飄移的除草劑，會影響周圍花卉苗木的生長。
有異味的除草劑 如2甲4氯的氣味對人有刺激，吸入它后，對人的胃有影響，對苗木也會產生藥害，不宜在苗圃、草坪中應用。取代脲類除草劑如綠麥隆、異丙隆等有異味，且是內吸傳導的除草劑，會降低苗木、花卉的品質，不宜使用。
滅生性除草劑 如草甘膦（農達）、百草枯（克無蹤）等。雖然有些苗木對低劑量草甘膦有一定耐性，但有時草甘膦對苗木的傷害是難以從直觀上明確判斷的，而且有時這種傷害是緩慢的，加上噴草甘膦時也難免會有飄移，會造成周圍敏感花卉苗木的傷害。
總之，在選用除草劑時，除了要考慮防止對花卉苗木草坪的直接傷害之外，也要防止一些潛在的、可能的、隱性的傷害，以免對花卉、苗木、草坪的產量、品質及周圍環境造成不可彌補的損傷。在使用中應注意根據不同的需要、品種、時期選用殺草譜廣、藥效期適中、根除效果好、無污染的除草劑。