許多細菌與真菌性病害在某些條件下癥狀相似，導致菜農朋友們常常識別不清，因而延誤防治時期。所以，根據病害發生的特點，正確區分病害類別很重要，所以要使用不同的殺菌劑來防治。
細菌性病害發生時，在發病部位經常出現潰爛、穿孔、生瘡、萎蔫、隆起、流膿等癥狀，有時還會發生腥臭味。這些都是辨別細菌性病害的重要依據。
西紅柿細菌性病害與葉霉病
西紅柿病葉：葉片背面發病部位凸起，顏色為淺綠色，比正常葉片的顏色稍淺，葉片正面發黃，這種凸起的病癥在花萼與果實連接的部位也有發生。據王師傅介紹，這種病害多從老葉開始發生，記者開始以為這是葉霉病，因為病癥與某些小型果西紅柿葉霉病的癥狀相似。但是據后王村農資店的任冬梅經理介紹，她做過實驗，用防治葉霉病的來這種病害沒有效果，反倒是細菌性病害的銅制劑和類的藥劑對其抑制效果明顯。記者將病葉取回來進行了培養，兩天以后發現病斑上沒有霉層、霉點等真菌性病害的特征出現，仔細觀察發現病斑上有淡淡的菌膿干后形成的菌膜，由此斷定是細菌性病害。
這種病害在一些抗病毒大紅品種上發生較多，特別提醒菜農們注意，發現后及早防治。
黃瓜霜霉病和細菌性角斑病
對于這兩種病害，種植黃瓜的菜農們都有很高的警惕心理，由于兩種病癥在葉片上的表現極為相似，所以同時防治這兩種病害是菜農們經常采取的辦法。兩種病害在葉上的表現都是在葉片背面初期出現水浸狀的斑點，后期病斑的發展受葉脈限制成不規則的多邊形，濕度大時霜霉病的病斑上著生有灰黑色的霉層，細菌性角斑病葉片背面盒莖稈的病斑上不長霉狀物，而是出現菌膿。霜霉病多只危害黃瓜的葉片，而細菌性角斑病還危害植株的果實和莖稈。
茄子棉疫病和細菌性軟腐病
茄子爛果情況十分嚴重。根據以前的經驗，誤以為這是茄子棉疫病，用了不少藥劑，可是沒有多大效果。丁師傅十分奇怪，往年噴上藥很快就可以減小，今年怎么就是不見起色呢？他拿了幾個病果去農資店咨詢，才知道今年發生的不是棉疫病，而是軟腐病。
茄子軟腐病和茄子棉疫病在發病的初期癥狀相似，都是出現水浸狀的病斑，而軟腐病隨著病斑的狂打，發生腐爛，病部聞起來很臭。茄子棉疫病俗稱“掉蛋”，發病后容易引起果實落果，在果實表皮發病初期為褐色病斑，稍凹陷，果實發黑腐爛，病部不出白色霉毛。
西紅柿細菌性斑點病和斑枯病
近壽光市古城街道沙埠屯村的王師傅說自己棚里的西紅柿葉片上了斑點，經銷商給了他三四種藥混在一起，有防治真菌的，也有防治細菌的，他就想咨詢一下記者。記者到棚中看到，病斑上有菌膿干了以后的痕跡，病斑多在葉葉緣發生，呈黑褐色，這應該是細菌性斑點病。與這種病癥相似的是西紅柿斑枯病，斑枯病的病斑也是深褐色病斑，但是仔細觀察會發現病斑的中心呈灰白色，病斑上散生一些小黑點。
細菌性病害可以使用銅制劑、或葉枯唑。但是，要想預防病害的發生和蔓延，仍應加強棚室的管理。
首先降低棚室中病原菌的數量，棚室中細菌性病害發生后，應盡早將發病的病葉、病果、病株等移出棚室，減少棚室中病原菌的數量。
其次，減少植株傷口，降低病原菌侵染的幾率。細菌性病害主要是從氣孔和傷口侵入，害蟲咬食和農事操作造成的傷口是病原菌主要的侵染途徑。首先注意防蟲，可以在棚室中設置黏蟲板，觀察蟲情。其次整株打杈，應選擇在晴天進行，同時加強藥劑防治。
，調節棚室環境，大部分的細菌性病害在20-30℃，相對濕度85%以上時易發生和傳播，管理中應注意盡量降低濕度，可以通過通風、合理灌溉等方式來降低濕度，控制病害的發生。